More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0041 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  100 
 
 		 468 aa  911    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  58.3 
 
 		 452 aa  501  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0563  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1121 aa  204  2e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0552395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0449  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1126 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.812136 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1170 aa  189  8e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0446  hypothetical protein  30.04 
 
 		 726 aa  186  6e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.722173 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0939  hypothetical protein  29.15 
 
 		 1157 aa  181  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.186942 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1503  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1085 aa  179  7e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1501  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1085 aa  179  7e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1038  hypothetical protein  28.57 
 
 		 487 aa  177  4e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0040  metal-dependent phosphohydrolase  29.91 
 
 		 1109 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1009  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1116 aa  168  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.804907 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0697  hypothetical protein  27.95 
 
 		 953 aa  160  6e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0694  hypothetical protein  27.13 
 
 		 958 aa  154  4e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1041  hypothetical protein  27.46 
 
 		 485 aa  154  4e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.880803 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0927  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1156 aa  152  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0257155 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0839  hypothetical protein  28.54 
 
 		 1105 aa  152  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0994214 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  27.59 
 
 		 472 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0355  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1111 aa  144  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0552395 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  31.77 
 
 		 479 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.11 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1743  hypothetical protein  30.13 
 
 		 485 aa  140  6e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.60384 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  28.99 
 
 		 483 aa  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  28.26 
 
 		 459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  28.26 
 
 		 459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  27.78 
 
 		 483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  29.9 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.18 
 
 		 484 aa  128  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  29.66 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0327  hypothetical protein  25.63 
 
 		 489 aa  127  5e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  28.26 
 
 		 459 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  24.78 
 
 		 462 aa  123  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  25.81 
 
 		 476 aa  123  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  25.42 
 
 		 487 aa  123  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  29.21 
 
 		 461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  24.41 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  29.57 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  26.72 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  28.04 
 
 		 460 aa  116  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  30.48 
 
 		 462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  27.78 
 
 		 459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  25.27 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 482 aa  113  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.05 
 
 		 533 aa  113  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  28.02 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1146  Na+/solute symporter  25.21 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.497129  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  25.77 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  25.96 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  25.55 
 
 		 482 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  22.38 
 
 		 486 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  25.37 
 
 		 537 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  25.62 
 
 		 478 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  26.99 
 
 		 500 aa  99  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  25.62 
 
 		 478 aa  97.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  25 
 
 		 486 aa  97.1  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  24.24 
 
 		 479 aa  95.1  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  24.28 
 
 		 479 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  23.83 
 
 		 461 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.87 
 
 		 526 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  24.36 
 
 		 487 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  25.14 
 
 		 506 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  28.18 
 
 		 509 aa  92.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  26.71 
 
 		 460 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  24.07 
 
 		 492 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  27.53 
 
 		 492 aa  90.5  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  24.07 
 
 		 492 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  23.7 
 
 		 492 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  23.65 
 
 		 493 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  24.68 
 
 		 476 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  25.21 
 
 		 508 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  25.19 
 
 		 492 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1569  hypothetical protein  24.68 
 
 		 468 aa  88.6  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  23.8 
 
 		 479 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  23.65 
 
 		 493 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  23.65 
 
 		 493 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  23.65 
 
 		 492 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  23.65 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  23.96 
 
 		 471 aa  89  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  25.51 
 
 		 492 aa  87.8  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  25.85 
 
 		 469 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  25.26 
 
 		 492 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  24.07 
 
 		 515 aa  87.4  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  25.77 
 
 		 544 aa  86.7  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  24.78 
 
 		 483 aa  86.7  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  23.73 
 
 		 482 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  24.44 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  22.51 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  25.85 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  24.48 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  24.55 
 
 		 507 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  27.34 
 
 		 551 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  23.31 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  22.73 
 
 		 485 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  22.2 
 
 		 596 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  24.38 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  24.5 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  25.2 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  27.89 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  27.89 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  20.65 
 
 		 472 aa  80.9  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>