More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0038 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0038  ABC-type transport system, ATPase and permease components  100 
 
 
576 aa  1132    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  38.92 
 
 
569 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  37.46 
 
 
611 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  39.59 
 
 
541 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  39.2 
 
 
569 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.5 
 
 
610 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3410  ABC transporter related  39.8 
 
 
588 aa  339  8e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  35.02 
 
 
591 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  35.69 
 
 
590 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  35.69 
 
 
579 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0447  ABC transporter related  38.05 
 
 
604 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  33.79 
 
 
583 aa  322  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  34.66 
 
 
607 aa  320  6e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  34.92 
 
 
600 aa  311  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  33.39 
 
 
581 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  31.3 
 
 
586 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  34.15 
 
 
598 aa  310  4e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  30.14 
 
 
582 aa  310  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  31.7 
 
 
588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  33.62 
 
 
584 aa  305  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  30.77 
 
 
585 aa  304  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1309  ATPase  35.54 
 
 
598 aa  303  6.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.469057  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  31.51 
 
 
589 aa  303  8.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  33.74 
 
 
588 aa  299  9e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  35.34 
 
 
583 aa  299  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  30.35 
 
 
593 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  29.98 
 
 
577 aa  297  3e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  31.59 
 
 
583 aa  296  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  29.76 
 
 
586 aa  295  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  30.74 
 
 
583 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  30.74 
 
 
583 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.74 
 
 
583 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.57 
 
 
583 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  29.97 
 
 
573 aa  295  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.57 
 
 
583 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  30.78 
 
 
583 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  29.26 
 
 
596 aa  294  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  27.88 
 
 
592 aa  293  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  29.98 
 
 
577 aa  293  7e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.4 
 
 
583 aa  292  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  30.42 
 
 
587 aa  292  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
574 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1468  ABC transporter related  33.5 
 
 
627 aa  292  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.308401  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  29.92 
 
 
598 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  33.16 
 
 
574 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  30.8 
 
 
583 aa  291  3e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  29.88 
 
 
573 aa  291  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  30.97 
 
 
583 aa  290  7e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  35.54 
 
 
650 aa  289  8e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  29.24 
 
 
583 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.22 
 
 
583 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  28.4 
 
 
581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  30.18 
 
 
583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.67 
 
 
583 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  32.22 
 
 
578 aa  281  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06901  multidrug ABC transporter  31.95 
 
 
583 aa  281  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.780793  normal  0.494245 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  30.53 
 
 
581 aa  280  3e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.89 
 
 
593 aa  278  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  32.87 
 
 
572 aa  277  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  31.3 
 
 
583 aa  276  5e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  28.6 
 
 
581 aa  276  7e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  31.69 
 
 
581 aa  276  8e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  28.82 
 
 
589 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10371  multidrug ABC transporter  30.72 
 
 
581 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0845  multidrug ABC transporter  31.28 
 
 
581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  31.12 
 
 
585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  30.39 
 
 
604 aa  274  3e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  30.92 
 
 
571 aa  274  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  31.86 
 
 
601 aa  271  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15751  multidrug ABC transporter  33.79 
 
 
583 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  31.06 
 
 
600 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  29.88 
 
 
595 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09061  multidrug ABC transporter  30.24 
 
 
581 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  29.44 
 
 
586 aa  266  7e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  31.36 
 
 
580 aa  266  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  29.39 
 
 
586 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  32.39 
 
 
603 aa  264  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  33.91 
 
 
641 aa  264  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  31.52 
 
 
606 aa  264  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.36 
 
 
586 aa  263  8e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.5 
 
 
586 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.22 
 
 
586 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  29.46 
 
 
586 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  28.21 
 
 
593 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  29.37 
 
 
597 aa  261  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  29.37 
 
 
597 aa  261  4e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.19 
 
 
587 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1636  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.5 
 
 
586 aa  260  6e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  29.04 
 
 
586 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.04 
 
 
586 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.59 
 
 
585 aa  259  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.04 
 
 
586 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  31.79 
 
 
584 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  26.87 
 
 
606 aa  258  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  31.16 
 
 
617 aa  257  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  29.12 
 
 
577 aa  257  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  29.64 
 
 
641 aa  257  4e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  30.03 
 
 
590 aa  256  7e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.09 
 
 
590 aa  256  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.03 
 
 
590 aa  256  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>