More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0035 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  658  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  34.87 
 
 
381 aa  197  2e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.31252e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  37.5 
 
 
363 aa  193  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  34.15 
 
 
345 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  33.87 
 
 
342 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  32.33 
 
 
366 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
380 aa  182  5e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.52679e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  36 
 
 
351 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  35.91 
 
 
353 aa  180  3e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  3.24218e-10 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  31.89 
 
 
339 aa  176  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  38.36 
 
 
386 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  37.97 
 
 
369 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  42.22 
 
 
339 aa  176  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  34.87 
 
 
348 aa  175  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  35.14 
 
 
336 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  36.25 
 
 
344 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  39.61 
 
 
335 aa  169  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  38.89 
 
 
362 aa  169  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  33.33 
 
 
336 aa  166  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  34.17 
 
 
348 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  31.68 
 
 
360 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  39.3 
 
 
336 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  38.04 
 
 
343 aa  160  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  38.24 
 
 
362 aa  159  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  38.22 
 
 
347 aa  158  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  38.01 
 
 
346 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  38.01 
 
 
346 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  31.6 
 
 
350 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  30.9 
 
 
309 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  28.76 
 
 
335 aa  156  5e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  30.33 
 
 
350 aa  153  3e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  33.44 
 
 
346 aa  153  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  28.94 
 
 
330 aa  153  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  38.82 
 
 
370 aa  151  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.51305e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  42.46 
 
 
344 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  41.59 
 
 
349 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  35.97 
 
 
338 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  37.78 
 
 
355 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  41.59 
 
 
349 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  37.54 
 
 
340 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  33.45 
 
 
353 aa  149  9e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  33.11 
 
 
350 aa  148  1e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  35.64 
 
 
350 aa  148  2e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  35.32 
 
 
338 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  33.22 
 
 
346 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  36.3 
 
 
308 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  28.8 
 
 
316 aa  145  8e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  36.44 
 
 
338 aa  145  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  34.29 
 
 
338 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
349 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.78 
 
 
336 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  37.83 
 
 
362 aa  142  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  28.66 
 
 
371 aa  142  1e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  31.54 
 
 
315 aa  142  1e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  34.88 
 
 
340 aa  141  1e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  32.23 
 
 
338 aa  141  2e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  35.75 
 
 
347 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  27.93 
 
 
358 aa  140  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  33.1 
 
 
317 aa  139  5e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  34.42 
 
 
342 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  31.75 
 
 
379 aa  139  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.63 
 
 
306 aa  139  9e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  36.07 
 
 
341 aa  139  9e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  32.73 
 
 
337 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  35.64 
 
 
349 aa  138  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  36.17 
 
 
367 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  34.6 
 
 
348 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  34.6 
 
 
348 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.44 
 
 
361 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  35.75 
 
 
347 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  34.6 
 
 
348 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  34.6 
 
 
348 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  41.31 
 
 
345 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  38.77 
 
 
308 aa  137  3e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.98345e-05  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  34.82 
 
 
368 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  34.55 
 
 
374 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.67 
 
 
334 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  30.19 
 
 
339 aa  136  6e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  1.41849e-06 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  34.45 
 
 
352 aa  136  6e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  34.82 
 
 
365 aa  136  6e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  29.47 
 
 
328 aa  135  7e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  34.55 
 
 
374 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  32.83 
 
 
337 aa  135  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  34.48 
 
 
331 aa  135  1e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  32.82 
 
 
341 aa  135  1e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  36.36 
 
 
337 aa  135  1e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.02 
 
 
332 aa  134  2e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  38.6 
 
 
359 aa  134  2e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  34.32 
 
 
344 aa  134  2e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  34.84 
 
 
374 aa  134  2e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  38.6 
 
 
331 aa  134  2e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  3.84441e-06 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  33.11 
 
 
352 aa  134  2e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  38.6 
 
 
345 aa  134  2e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  34.73 
 
 
352 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  34.73 
 
 
370 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.42 
 
 
343 aa  133  4e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  34.73 
 
 
352 aa  133  4e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  27.85 
 
 
305 aa  132  7e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  36.79 
 
 
342 aa  130  2e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  31.31 
 
 
351 aa  130  2e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>