More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0031 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0031  chemotaxis protein histidine kinase, CheA-like  100 
 
 		 607 aa  1209    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0721  CheA signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 544 aa  332  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 666 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0622  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 543 aa  301  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 660 aa  295  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3091  CheA signal transduction histidine kinases  43.56 
 
 		 538 aa  294  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.832082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  30.22 
 
 		 685 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 598 aa  290  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  30.09 
 
 		 660 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3196  CheA signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 542 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 770 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 697 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4461  CheA signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 662 aa  278  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 655 aa  276  6e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0636  CheA signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 544 aa  276  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83539e-26 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3199  chemotaxis protein CheA  41.87 
 
 		 561 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4452  CheA signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 		 680 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 653 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4471  CheA signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 		 684 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.710344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  28.32 
 
 		 672 aa  274  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4316  CheA signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 		 674 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  28.38 
 
 		 667 aa  273  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 658 aa  273  7e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  28.38 
 
 		 667 aa  273  7e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  28.23 
 
 		 667 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  27.8 
 
 		 667 aa  273  9e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  31.15 
 
 		 601 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 656 aa  270  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 728 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  28.99 
 
 		 670 aa  266  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  28.32 
 
 		 769 aa  266  7e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 607 aa  266  8e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 673 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  28.17 
 
 		 783 aa  265  1e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  28.68 
 
 		 670 aa  265  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 657 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 675 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  27.68 
 
 		 769 aa  261  2e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 878 aa  261  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  30.07 
 
 		 910 aa  260  4e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 603 aa  261  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  27.96 
 
 		 769 aa  261  4e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  27.84 
 
 		 770 aa  258  3e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  30.56 
 
 		 888 aa  257  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 673 aa  257  4e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  36.62 
 
 		 1089 aa  256  6e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 604 aa  256  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 650 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  30.62 
 
 		 766 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  35.82 
 
 		 714 aa  252  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 1030 aa  252  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  29.91 
 
 		 655 aa  252  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  35 
 
 		 897 aa  252  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 713 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  30.12 
 
 		 674 aa  251  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 671 aa  250  5e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 691 aa  250  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  31.44 
 
 		 625 aa  250  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  30.72 
 
 		 652 aa  249  9e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  36.25 
 
 		 751 aa  249  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 681 aa  249  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 759 aa  249  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 654 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 954 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 743 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 747 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 671 aa  248  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  31.03 
 
 		 654 aa  248  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  27.77 
 
 		 770 aa  248  3e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 747 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  30.88 
 
 		 654 aa  247  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  30.88 
 
 		 652 aa  247  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  30.88 
 
 		 654 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 745 aa  247  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 739 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  36.29 
 
 		 754 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  30.88 
 
 		 654 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  30.88 
 
 		 654 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 919 aa  246  6e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 682 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 652 aa  246  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  30.72 
 
 		 654 aa  246  8e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  40.75 
 
 		 552 aa  246  9e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 654 aa  246  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  40.75 
 
 		 552 aa  246  9e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0577  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 556 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.482834  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  36.25 
 
 		 744 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  30.37 
 
 		 1010 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 760 aa  245  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 1031 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.73 
 
 		 754 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 921 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  36.2 
 
 		 748 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  28.68 
 
 		 662 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  36.2 
 
 		 753 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 670 aa  244  5e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  36.86 
 
 		 610 aa  243  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  35.75 
 
 		 744 aa  243  6e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 920 aa  243  7e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>