More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0028 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 329 aa  648    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  51.37 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  50.76 
 
 		 329 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  51.07 
 
 		 323 aa  279  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  50.76 
 
 		 324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  49.24 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  47.11 
 
 		 333 aa  263  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  43.33 
 
 		 331 aa  229  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  43.32 
 
 		 338 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  43.5 
 
 		 323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  41.52 
 
 		 336 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  38.32 
 
 		 334 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  44.75 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  38.34 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  43.56 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  43.47 
 
 		 324 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  41.28 
 
 		 318 aa  205  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  44.27 
 
 		 333 aa  202  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  38.6 
 
 		 321 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  36.16 
 
 		 355 aa  199  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  41.95 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  44.71 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  38.73 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  42.07 
 
 		 329 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  42.07 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  40.88 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  39.58 
 
 		 320 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  41.77 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  40.73 
 
 		 326 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  40.54 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  42.31 
 
 		 323 aa  196  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  41.18 
 
 		 323 aa  195  9e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  41.42 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  40.43 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  37.94 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  39.16 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  41.42 
 
 		 318 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  40.43 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  41.16 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  40.43 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  42.72 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  41.46 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  41.64 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  40.85 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  41.16 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  40.91 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  40.96 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  44.11 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  41.16 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  41.16 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  41.16 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  41.34 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  41.16 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  41.16 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  41.1 
 
 		 318 aa  193  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  40.52 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  41.1 
 
 		 318 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  40.85 
 
 		 323 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  43.86 
 
 		 326 aa  192  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  39.75 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  40.24 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  42.26 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  40.52 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  41.34 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  43.4 
 
 		 332 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  41.87 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  41.03 
 
 		 326 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  41.87 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  43.24 
 
 		 332 aa  189  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  37.39 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  37.39 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  40.43 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  40.58 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  38.39 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  38.1 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  39.27 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  42.6 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  41.69 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  42.09 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  39.06 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  37.54 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  39.31 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  36.72 
 
 		 355 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  38.82 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  41.87 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  35.76 
 
 		 314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  38.14 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  39.82 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  35.55 
 
 		 315 aa  182  8.000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  42.59 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  38.55 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  36.93 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  42.6 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  35.47 
 
 		 358 aa  179  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  38.37 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  36.36 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  39.14 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1843  thiamine monophosphate kinase  40.66 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.523623  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  38.51 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  41.76 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>