218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0019 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  100 
 
 
480 aa  974  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.40083e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  59.62 
 
 
477 aa  576  1e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  57.71 
 
 
484 aa  560  1e-158  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  58.25 
 
 
486 aa  557  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  57.05 
 
 
486 aa  550  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  55.53 
 
 
486 aa  545  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  56.58 
 
 
486 aa  540  1e-152  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  56.09 
 
 
480 aa  535  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  53.94 
 
 
480 aa  532  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  55.74 
 
 
486 aa  530  1e-149  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  55.22 
 
 
480 aa  527  1e-148  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  52.07 
 
 
480 aa  514  1e-145  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  55.49 
 
 
482 aa  516  1e-145  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  52.51 
 
 
474 aa  514  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  51.67 
 
 
500 aa  512  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  52.51 
 
 
474 aa  508  1e-142  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  58.09 
 
 
484 aa  503  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  56.85 
 
 
487 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  56.43 
 
 
488 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  56.43 
 
 
487 aa  494  1e-138  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  63.38 
 
 
988 aa  490  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  54.77 
 
 
479 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  51.04 
 
 
477 aa  484  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  51.66 
 
 
478 aa  480  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  50 
 
 
484 aa  476  1e-133  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  51.42 
 
 
498 aa  474  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  54.04 
 
 
477 aa  468  1e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  50.21 
 
 
482 aa  471  1e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  48.86 
 
 
484 aa  466  1e-130  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  50 
 
 
486 aa  465  1e-130  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  50.94 
 
 
473 aa  466  1e-130  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  49.34 
 
 
482 aa  467  1e-130  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  49.07 
 
 
493 aa  463  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  50.31 
 
 
484 aa  459  1e-128  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  49.48 
 
 
486 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  45.8 
 
 
472 aa  456  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  48.85 
 
 
476 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  48.85 
 
 
476 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  49.27 
 
 
486 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  48.04 
 
 
484 aa  454  1e-126  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  1.83648e-06  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  46.56 
 
 
477 aa  452  1e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  49.59 
 
 
481 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  50.43 
 
 
473 aa  449  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  46.47 
 
 
485 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  50.83 
 
 
477 aa  451  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  50.22 
 
 
460 aa  451  1e-125  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  5.73149e-07  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  51.04 
 
 
476 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  52.3 
 
 
475 aa  445  1e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  47.51 
 
 
485 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  48.02 
 
 
475 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  49.17 
 
 
476 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  51.96 
 
 
477 aa  443  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  50.94 
 
 
476 aa  441  1e-122  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  46.99 
 
 
488 aa  438  1e-122  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  46.19 
 
 
485 aa  441  1e-122  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  51.77 
 
 
476 aa  440  1e-122  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  46.89 
 
 
485 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  46.76 
 
 
488 aa  436  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  47.01 
 
 
443 aa  436  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  50 
 
 
476 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  47.55 
 
 
486 aa  435  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  50.74 
 
 
477 aa  433  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  49.79 
 
 
473 aa  431  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  54.04 
 
 
472 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  49.69 
 
 
476 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  53.74 
 
 
432 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  53.04 
 
 
472 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  4.19114e-06 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  43.96 
 
 
477 aa  416  1e-115  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  48.83 
 
 
963 aa  417  1e-115  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  54.98 
 
 
475 aa  416  1e-115  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  50 
 
 
514 aa  411  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  52.98 
 
 
465 aa  408  1e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  43.23 
 
 
502 aa  396  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  43.86 
 
 
478 aa  375  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  43.17 
 
 
462 aa  344  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  40.55 
 
 
447 aa  308  2e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  31.57 
 
 
451 aa  220  4e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  30.09 
 
 
396 aa  167  3e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  33.78 
 
 
472 aa  163  5e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  34.66 
 
 
511 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  30.36 
 
 
514 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  30.06 
 
 
466 aa  159  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  31.15 
 
 
395 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  31.95 
 
 
463 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  29.39 
 
 
466 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  30.75 
 
 
384 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  31.28 
 
 
462 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  30.75 
 
 
407 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  31.6 
 
 
395 aa  142  1e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3081  protein of unknown function UPF0027  31.12 
 
 
409 aa  142  1e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  30.32 
 
 
402 aa  142  1e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  31.81 
 
 
439 aa  142  2e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  30.47 
 
 
410 aa  141  2e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  31.14 
 
 
394 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0812  hypothetical protein  30.94 
 
 
391 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.217299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  28.54 
 
 
409 aa  140  4e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  30.28 
 
 
398 aa  140  4e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  30.2 
 
 
389 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  31.31 
 
 
398 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  29.66 
 
 
409 aa  138  3e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>