40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0018 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0018  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  323  7e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.4858e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  37.41 
 
 
143 aa  82.8  2e-15  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  37.96 
 
 
138 aa  72.4  2e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4796  protein of unknown function DUF101  35.71 
 
 
140 aa  64.7  5e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  31.21 
 
 
146 aa  64.7  5e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  34.92 
 
 
139 aa  63.9  9e-10  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  33.09 
 
 
138 aa  62.4  2e-09  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0741  hypothetical protein  32.59 
 
 
138 aa  60.5  9e-09  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0822  hypothetical protein  28.87 
 
 
138 aa  58.9  2e-08  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.303013  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0196  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  57.8  6e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  26.24 
 
 
143 aa  57  9e-08  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  28.47 
 
 
138 aa  56.6  1e-07  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  28.47 
 
 
136 aa  57  1e-07  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2143  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  56.6  2e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  34.29 
 
 
135 aa  55.1  4e-07  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0332  protein of unknown function DUF101  26.39 
 
 
140 aa  54.3  6e-07  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0412  protein of unknown function DUF101  27.95 
 
 
159 aa  53.5  1e-06  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00074949  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0707  hypothetical protein  27.59 
 
 
147 aa  52.8  2e-06  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  29.13 
 
 
139 aa  53.1  2e-06  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  29.73 
 
 
165 aa  52.4  3e-06  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1546  hypothetical protein  26.03 
 
 
140 aa  51.6  4e-06  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  28.97 
 
 
147 aa  52  4e-06  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  28.17 
 
 
147 aa  51.6  5e-06  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0242  hypothetical protein  26.81 
 
 
138 aa  51.6  5e-06  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0957  archease family protein  26.43 
 
 
138 aa  50.8  7e-06  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.395937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1671  hypothetical protein  26.81 
 
 
138 aa  49.7  1e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.532408  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  27.27 
 
 
150 aa  48.9  3e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  37.04 
 
 
135 aa  48.5  3e-05  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0373  protein of unknown function DUF101  29.5 
 
 
142 aa  48.1  5e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2022  protein of unknown function DUF101  29.33 
 
 
148 aa  47.8  6e-05  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.367905 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1831  hypothetical protein  26.62 
 
 
150 aa  47.8  7e-05  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  5.7693e-05  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  29.73 
 
 
135 aa  47.8  7e-05  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  1.565e-07  hitchhiker  4.15863e-05 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0128  hypothetical protein  30.95 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  32.8 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2562  protein of unknown function DUF101  32.35 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  26.24 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2728  hypothetical protein  30.08 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21951  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1267  hypothetical cytosolic protein  24.06 
 
 
139 aa  42.4  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0902  hypothetical protein  35.38 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0988  protein of unknown function DUF101  28.79 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>