164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0016 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 
88 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  90.8 
 
 
88 aa  158  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  75.29 
 
 
91 aa  135  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  75.29 
 
 
91 aa  135  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  76.47 
 
 
91 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  76.47 
 
 
91 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  75.29 
 
 
91 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  76.19 
 
 
91 aa  134  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  70.93 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  70.59 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  52.17 
 
 
93 aa  87.4  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  53.09 
 
 
93 aa  87.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  55.26 
 
 
95 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  66.18 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  51.09 
 
 
93 aa  83.6  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  58.44 
 
 
90 aa  83.6  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2086  ATP synthase F0, C subunit  67.27 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000184566  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  49.43 
 
 
93 aa  82  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  61.54 
 
 
96 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  49.38 
 
 
93 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  52.44 
 
 
92 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  48.05 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  65.45 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0947  F0F1 ATP synthase subunit C  51.39 
 
 
93 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0801028  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0468  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
93 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.160143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3101  F0F1 ATP synthase subunit C  59.02 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00136484  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  46.25 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1389  ATP synthase F0, C subunit  60 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  46.25 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  46.25 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  58.62 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  47.95 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  47.89 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2994  F0F1 ATP synthase subunit C  48.78 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2331  F0F1 ATP synthase subunit C  49.38 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  42.47 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1201  ATP synthase F0 sector, C subunit  46.15 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  43.42 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2701  ATP synthase F0, C subunit  58.49 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.025291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  54.24 
 
 
82 aa  67  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  54.24 
 
 
81 aa  67  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  54.24 
 
 
81 aa  67  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  50.82 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  52.54 
 
 
81 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  52.54 
 
 
81 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  45.07 
 
 
82 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  49.3 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1883  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.099934  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  52.54 
 
 
81 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  52.63 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  54.55 
 
 
81 aa  63.9  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  51.79 
 
 
88 aa  63.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1014  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0943  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  54.55 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0878  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00312668  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0128  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 
82 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1051  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 
82 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0424  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 
82 aa  62  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173635  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1295  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490401  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2789  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 
82 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2647  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 
82 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0152  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 
82 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0463692  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  49.15 
 
 
81 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  49.15 
 
 
81 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5555  F0F1 ATP synthase subunit C  42.25 
 
 
82 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972976  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  46.15 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4471  H+transporting two-sector ATPase C subunit  52.08 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  46.03 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  38.36 
 
 
321 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1435  F0F1 ATP synthase subunit C  43.59 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213661  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0134  H+transporting two-sector ATPase C subunit  41.56 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.331941  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  51.02 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  48.44 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0957  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1502  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0429  F0F1 ATP synthase subunit C  47.27 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.00000000000398633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2850  ATP synthase F0, C subunit  38.1 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0959232 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0646  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  53.49 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.643496  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  33.33 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  50.85 
 
 
75 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  35.53 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  40.62 
 
 
95 aa  51.2  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000022409  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2170  ATP synthase F0, C subunit  37.66 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3741  F0F1 ATP synthase subunit C  52.5 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  42.65 
 
 
76 aa  50.8  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  38.24 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  38.24 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2849  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>