More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0015 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
234 aa  455  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.26077e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  74.79 
 
 
234 aa  346  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  57.74 
 
 
229 aa  268  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.61102e-06  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  56.9 
 
 
229 aa  267  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  57.63 
 
 
230 aa  258  5e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  2.47619e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  55.65 
 
 
229 aa  253  2e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  56.07 
 
 
229 aa  249  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  53.97 
 
 
229 aa  249  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.43086e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  54.39 
 
 
229 aa  249  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  54.39 
 
 
229 aa  248  8e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.62325e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  49.79 
 
 
239 aa  228  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  50.64 
 
 
229 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.05788e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  49.75 
 
 
234 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  48.77 
 
 
233 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  47.78 
 
 
233 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  45.32 
 
 
233 aa  192  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  46.31 
 
 
207 aa  191  8e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.17673e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  45.5 
 
 
234 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  43.9 
 
 
226 aa  171  8e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  43.9 
 
 
226 aa  171  8e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  43.9 
 
 
226 aa  169  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  45.69 
 
 
218 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  40.95 
 
 
227 aa  165  7e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  39.27 
 
 
226 aa  164  1e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  41.78 
 
 
225 aa  163  2e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  48.77 
 
 
226 aa  162  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  6.56805e-05  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  52.27 
 
 
258 aa  162  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  41.55 
 
 
224 aa  156  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  41.46 
 
 
226 aa  155  5e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  39.23 
 
 
225 aa  154  8e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  40.27 
 
 
228 aa  146  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  40.59 
 
 
232 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  38.19 
 
 
231 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  42.78 
 
 
245 aa  139  5e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  36.15 
 
 
251 aa  139  5e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  37.09 
 
 
223 aa  137  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  39.64 
 
 
217 aa  134  1e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  36.32 
 
 
231 aa  134  1e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  38.07 
 
 
232 aa  134  1e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  36.41 
 
 
227 aa  133  2e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  38.66 
 
 
216 aa  130  2e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  37.88 
 
 
217 aa  129  4e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  39.09 
 
 
230 aa  128  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  34.88 
 
 
243 aa  128  7e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  38.31 
 
 
228 aa  127  1e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  36.15 
 
 
231 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  38.81 
 
 
227 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  3.42736e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  33.81 
 
 
257 aa  125  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  38.81 
 
 
227 aa  125  8e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  35 
 
 
246 aa  125  8e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  37.44 
 
 
241 aa  124  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  37.44 
 
 
241 aa  123  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  34.74 
 
 
239 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  34.18 
 
 
228 aa  121  1e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  36.5 
 
 
233 aa  120  2e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  36.11 
 
 
232 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  36.02 
 
 
194 aa  119  4e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  43.86 
 
 
220 aa  119  5e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  35.41 
 
 
246 aa  118  1e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  36.67 
 
 
241 aa  117  2e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  40.7 
 
 
228 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  33.98 
 
 
223 aa  116  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  32.57 
 
 
229 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  39.11 
 
 
251 aa  115  8e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  3.81865e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  39.11 
 
 
251 aa  115  8e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  32.84 
 
 
236 aa  115  8e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  36.54 
 
 
231 aa  114  1e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  37.62 
 
 
241 aa  114  2e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  39.18 
 
 
241 aa  114  2e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  36.54 
 
 
249 aa  114  2e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  37.62 
 
 
241 aa  114  2e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  39.07 
 
 
252 aa  113  2e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  34.93 
 
 
268 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  33.04 
 
 
251 aa  112  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  34.16 
 
 
239 aa  111  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  35.94 
 
 
230 aa  110  1e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  32.66 
 
 
224 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  34.91 
 
 
364 aa  109  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  38.94 
 
 
261 aa  109  4e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  31.28 
 
 
241 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  35.92 
 
 
233 aa  108  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  37.74 
 
 
373 aa  108  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 
229 aa  108  7e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  39.58 
 
 
188 aa  108  8e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  33.88 
 
 
249 aa  108  9e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  37.62 
 
 
241 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  38.12 
 
 
257 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  36.49 
 
 
271 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  37.62 
 
 
241 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  37.62 
 
 
241 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  31.98 
 
 
243 aa  105  5e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  34.55 
 
 
250 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  35.45 
 
 
249 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  38.35 
 
 
253 aa  104  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  28.34 
 
 
251 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 
241 aa  103  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
247 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  32.56 
 
 
247 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  31.43 
 
 
235 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  34.69 
 
 
248 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>