30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0013 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  165  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.01969e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  48.68 
 
 
80 aa  81.3  4e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.15703e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  47.37 
 
 
80 aa  80.1  1e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2667  hypothetical protein  50.67 
 
 
78 aa  78.6  3e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000715899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3357  hypothetical protein  48.72 
 
 
89 aa  78.6  3e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.044e-09  hitchhiker  0.0072657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1509  hypothetical protein  48 
 
 
79 aa  77  8e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1386  ATP synthase protein I  42.86 
 
 
91 aa  76.6  1e-13  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  47.14 
 
 
87 aa  74.7  4e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3140  hypothetical protein  45.68 
 
 
80 aa  72.8  1e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  3.79803e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2064  ATP synthase protein I  40.26 
 
 
92 aa  72.8  2e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0336  hypothetical protein  42.68 
 
 
81 aa  71.6  3e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4246  hypothetical protein  44.59 
 
 
93 aa  71.2  5e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.85685e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2089  ATP synthase protein I  41.77 
 
 
101 aa  70.9  6e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0218096  normal  0.87278 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2698  ATP synthase protein I  50.79 
 
 
91 aa  69.7  1e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  41.25 
 
 
79 aa  64.3  6e-10  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  3.80142e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  39.74 
 
 
79 aa  60.1  9e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  31.51 
 
 
71 aa  58.5  3e-08  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2252  hypothetical protein  35.71 
 
 
118 aa  56.2  1e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00019318  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4474  hypothetical protein  43.28 
 
 
83 aa  53.9  8e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2386  hypothetical protein  38.46 
 
 
90 aa  47  9e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0414094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  43.48 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1281  hypothetical protein  30.65 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0902065  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0744  hypothetical protein  43.9 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.32586  normal  0.360588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2595  ATP synthase F0, subunit I  39.34 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1894  putative ATP synthase  39.29 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0232779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  46.34 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  3.87976e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0309  ATP synthase protein I  31.65 
 
 
80 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  5.34285e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0511  ATP synthase protein, subunit I  29.69 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277873  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0578  hypothetical protein  33.33 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.714633  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3744  hypothetical protein  28 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>