111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2167 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2167  nodulation efficiency protein NfeD  100 
 
 		 428 aa  858    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0014  hypothetical protein  74.53 
 
 		 427 aa  622  1e-177  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1056  hypothetical protein  72.88 
 
 		 438 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.919893 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0068  hypothetical protein  36.39 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  34.59 
 
 		 437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  35.66 
 
 		 421 aa  189  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  34.47 
 
 		 442 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  31.04 
 
 		 429 aa  176  5e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  30.79 
 
 		 459 aa  176  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  33.55 
 
 		 453 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  29.91 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  29.16 
 
 		 489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  30.71 
 
 		 446 aa  163  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0527  non-proteolytic membrane spanning protein, peptidase family S49  31.8 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  30.93 
 
 		 447 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  28.82 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  30.72 
 
 		 496 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1661  nfeD family protein  31.34 
 
 		 458 aa  156  8e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.125508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  32.28 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  30.96 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  32.52 
 
 		 439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  30.26 
 
 		 462 aa  153  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  31.32 
 
 		 449 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  30.93 
 
 		 448 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  31.57 
 
 		 491 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1395  hypothetical protein  37.34 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51965  normal  0.883409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  29 
 
 		 472 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  31.16 
 
 		 448 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  29.72 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  30.61 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  29.52 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  31.75 
 
 		 438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  30.21 
 
 		 481 aa  147  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  32.55 
 
 		 433 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  29.47 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  29.44 
 
 		 462 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1477  hypothetical protein  29.37 
 
 		 436 aa  143  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1590  protein of unknown function DUF107  31.96 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  29.71 
 
 		 524 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0813  nodulation efficiency protein NfeD  31.72 
 
 		 446 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000363847  hitchhiker  0.000000223757 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  29 
 
 		 464 aa  140  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  29.44 
 
 		 488 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0803  hypothetical protein  29.73 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2176  nodulation efficiency protein D  28.44 
 
 		 560 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1495  protein of unknown function DUF107  31.87 
 
 		 471 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0824  NfeD family protein  28.29 
 
 		 501 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0916  NfeD family protein  28.67 
 
 		 503 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2149  hypothetical protein  29.12 
 
 		 488 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  28.6 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  30.34 
 
 		 437 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  27.41 
 
 		 557 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0990  hypothetical protein  28.47 
 
 		 453 aa  132  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.781723 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4387  hypothetical protein  27.95 
 
 		 525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98413  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  26.87 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  27.73 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000176034  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1783  hypothetical protein  26.83 
 
 		 490 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0712  membrane-bound serine protease  27.41 
 
 		 525 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  29.7 
 
 		 465 aa  130  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  28.94 
 
 		 467 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2887  hypothetical protein  27.74 
 
 		 501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05880  putative membrane-bound protease  30.44 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  28.57 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  30.91 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5321  hypothetical protein  27.43 
 
 		 516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00956153  decreased coverage  0.00774804 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5124  hypothetical protein  27.45 
 
 		 508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417825 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2369  nodulation efficiency protein NfeD  31.95 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3402  hypothetical protein  27.69 
 
 		 519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4965  hypothetical protein  27.69 
 
 		 519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4906  hypothetical protein  28.01 
 
 		 528 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.349599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  27.71 
 
 		 454 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  27.29 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0553  putative lipoprotein  29.53 
 
 		 443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2658  hypothetical protein  28.87 
 
 		 501 aa  127  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.853599  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3029  hypothetical protein  27.73 
 
 		 501 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  29.7 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1160  nodulation efficiency protein NfeD  28.43 
 
 		 445 aa  123  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00735841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3380  protein of unknown function DUF107  26.57 
 
 		 467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  26 
 
 		 473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1515  hypothetical protein  29.74 
 
 		 486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.331785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1336  hypothetical protein  27.57 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.965224  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1169  protein of unknown function DUF107  27.21 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  31.71 
 
 		 425 aa  114  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1023  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  29.18 
 
 		 529 aa  113  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1013  protein of unknown function DUF107  26.73 
 
 		 455 aa  113  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1959  membrane-bound serine protease (ClpP class), putative  27.79 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1501  hypothetical protein  28.79 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1572  hypothetical protein  26.33 
 
 		 498 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1623  hypothetical protein  27.27 
 
 		 464 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.475533 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1306  NfeD protein  29.01 
 
 		 443 aa  108  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2190  hypothetical protein  28.27 
 
 		 468 aa  106  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  27.65 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  27.36 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1786  hypothetical protein  26.56 
 
 		 500 aa  98.6  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  26.15 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  27.66 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0037  nodulation efficiency protein NfeD  27.75 
 
 		 452 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280773  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1082  hypothetical protein  23.53 
 
 		 546 aa  86.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409123  hitchhiker  0.00827512 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5652  protein of unknown function DUF107  26.45 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.995494 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0841  hypothetical protein  25.49 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1818  hypothetical protein  26.23 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163142  normal  0.174622 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>