More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2161 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 268 aa  528  1e-149  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  80.93 
 
 		 259 aa  422  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  78.12 
 
 		 256 aa  413  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  74.71 
 
 		 261 aa  402  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  51.36 
 
 		 261 aa  198  6e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1931  GTP-binding protein YlqF  37.97 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  39.52 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  38.46 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  35.43 
 
 		 374 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  38.61 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  34.51 
 
 		 384 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  34.9 
 
 		 388 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  33.85 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.47 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  30.23 
 
 		 379 aa  136  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  32.64 
 
 		 597 aa  135  9e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  32.75 
 
 		 534 aa  133  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  34.44 
 
 		 717 aa  130  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  32.97 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  31.72 
 
 		 443 aa  125  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  33.92 
 
 		 360 aa  124  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  32.56 
 
 		 560 aa  122  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  31.38 
 
 		 521 aa  122  9e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  32.17 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  35.47 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  37.5 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  30.04 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  30.6 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  30.22 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  31.37 
 
 		 669 aa  116  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  31.3 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  30 
 
 		 296 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  30 
 
 		 296 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  32.06 
 
 		 314 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  30.64 
 
 		 544 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  30 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  30 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  30 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  27.82 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  30 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  29.63 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  30.22 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  29.85 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  32.06 
 
 		 314 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  32.44 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  30.71 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  33.2 
 
 		 313 aa  112  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  31.68 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  32.79 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  32.79 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  31.85 
 
 		 562 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  33.21 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  29.77 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  31.3 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  30.65 
 
 		 312 aa  108  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  30.98 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  30.89 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  31.98 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  30.98 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  30.23 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  29.17 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  30.89 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  30.89 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  30.89 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  31.98 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  31.92 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  31.79 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  28.52 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  34.4 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  31.39 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2120  GTPase  33.87 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  29.82 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  31.43 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  29.56 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  29.13 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  32.72 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  30.47 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  32.44 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77411  predicted protein  28.09 
 
 		 653 aa  103  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  29.28 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2179  predicted protein  30.06 
 
 		 378 aa  102  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.805213  decreased coverage  0.000732595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  33.06 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  28.9 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  32.93 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  30.31 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  29.17 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  28.3 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  32.27 
 
 		 317 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  28.3 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  28.52 
 
 		 312 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  26.49 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  32.09 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  31.1 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  27.8 
 
 		 281 aa  96.3  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  28.83 
 
 		 284 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  27.48 
 
 		 323 aa  95.9  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  29.23 
 
 		 277 aa  95.5  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0827  GTP-binding protein HSR1-related  31.56 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3396  GTP-binding  29.78 
 
 		 330 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3634  ribosomal biogenesis GTPase  27.38 
 
 		 334 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>