More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2146 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2146  small GTP-binding protein  100 
 
 		 385 aa  770    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0033  GTP-binding proten HflX  76.8 
 
 		 403 aa  617  1e-175  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00542605 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0036  small GTP-binding protein  72.97 
 
 		 381 aa  587  1e-167  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1075  small GTP-binding protein  77.65 
 
 		 372 aa  587  1e-166  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0139  GTP-binding protein HSR1-related  48.44 
 
 		 409 aa  328  9e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0708  small GTP-binding protein  44.38 
 
 		 424 aa  248  9e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131906  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1605  GTP1/OBG protein  40.45 
 
 		 371 aa  229  4e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0351  GTP-binding protein  37.5 
 
 		 436 aa  216  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.304263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1550  GTP-binding proten HflX  37.54 
 
 		 405 aa  206  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.990824  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  39.5 
 
 		 489 aa  204  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  39.5 
 
 		 489 aa  204  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  39.18 
 
 		 481 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  42.48 
 
 		 421 aa  202  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  39.54 
 
 		 414 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1246  GTP-binding proten HflX  33.04 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  39.26 
 
 		 414 aa  201  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1303  GTP-binding proten HflX  36.31 
 
 		 449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  38.46 
 
 		 512 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  37.05 
 
 		 433 aa  195  9e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  42.07 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0828  GTP-binding proten HflX  36.69 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  35.77 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2277  small GTP-binding protein  36.9 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.92801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1710  GTP-binding proten HflX  37.29 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  38.42 
 
 		 429 aa  193  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2411  small GTP-binding protein  35.29 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000356758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  36.31 
 
 		 454 aa  192  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  40 
 
 		 395 aa  193  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  39.07 
 
 		 441 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  39.43 
 
 		 460 aa  192  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2404  GTP-binding proten HflX  37.18 
 
 		 436 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.115751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  39.05 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  39.05 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  39.05 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  36.29 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  39.03 
 
 		 509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  39.23 
 
 		 442 aa  190  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  36.17 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  36.15 
 
 		 454 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  39.62 
 
 		 432 aa  189  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  38.42 
 
 		 436 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  38.69 
 
 		 434 aa  189  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  38.94 
 
 		 436 aa  189  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  37.7 
 
 		 417 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  38.06 
 
 		 433 aa  189  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  37.6 
 
 		 433 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  38.48 
 
 		 596 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  37.14 
 
 		 429 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  36.68 
 
 		 502 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  36.57 
 
 		 450 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  38.27 
 
 		 433 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  37.65 
 
 		 434 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  37.32 
 
 		 428 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.34 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  39.81 
 
 		 479 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  38.66 
 
 		 435 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  37.5 
 
 		 485 aa  186  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  35.88 
 
 		 440 aa  186  7e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  34.97 
 
 		 461 aa  186  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  35.67 
 
 		 465 aa  185  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  37.9 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  34.64 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1104  GTP-binding protein HflX  36.25 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  36.52 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  35.77 
 
 		 441 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  34.22 
 
 		 435 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  36.14 
 
 		 517 aa  184  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  37.09 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0625  GTP-binding proten HflX  35.73 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00182649  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  36 
 
 		 429 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  37.21 
 
 		 396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  38.15 
 
 		 387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  38.15 
 
 		 392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  38.15 
 
 		 387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  38.15 
 
 		 387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  38.15 
 
 		 387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  38.15 
 
 		 387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.42 
 
 		 493 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  38.15 
 
 		 392 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  38.3 
 
 		 431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  36.52 
 
 		 433 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  36.31 
 
 		 413 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  37.86 
 
 		 387 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  38 
 
 		 484 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  34.63 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  38.94 
 
 		 515 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  36.63 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  36.63 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  36.63 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  36.29 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  38.02 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  34.83 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  34.05 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  36.63 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  36.63 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  38.02 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  38.03 
 
 		 493 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  35.85 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1932  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.18 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  36.59 
 
 		 432 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>