146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2063 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  715    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2291  hypothetical protein  64.8 
 
 		 358 aa  448  1e-125  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0761399 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  62.57 
 
 		 358 aa  442  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1933  hypothetical protein  65.08 
 
 		 358 aa  408  1e-113  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0893  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  29.23 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  31.63 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  25.16 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  28.28 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  25.33 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  22.55 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  26.04 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  23.76 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  25.2 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  29.03 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  27.92 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  24.22 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  24.83 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  26.14 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.56 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  27.57 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  27.72 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  26.13 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  28.17 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  24.38 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  24.65 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.5 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4237  putative oxidoreductase  24.2 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  23.66 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  28.4 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3414  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  26.58 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.53 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  25.88 
 
 		 406 aa  57  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0160  FAD dependent oxidoreductase  25.17 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.03 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  24.46 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0687  FAD dependent oxidoreductase  24.25 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000330964  unclonable  0.000000300742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  26.18 
 
 		 418 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  35.56 
 
 		 402 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  22.26 
 
 		 348 aa  53.5  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  23.71 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 		 407 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  24.79 
 
 		 390 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  26.73 
 
 		 379 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  24.68 
 
 		 455 aa  52.8  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  25.58 
 
 		 387 aa  52.8  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  26.98 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  33.13 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  25.16 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  27.17 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  30.43 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  39.33 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  26.85 
 
 		 443 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  21.7 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5158  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  38.52 
 
 		 671 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0654699  normal  0.0882409 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.02 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.85 
 
 		 443 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  31.85 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  24.19 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  28.78 
 
 		 391 aa  50.4  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  24.19 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.39 
 
 		 446 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  33.58 
 
 		 405 aa  50.1  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  38.78 
 
 		 374 aa  50.1  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  26.88 
 
 		 399 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.71 
 
 		 446 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  34.81 
 
 		 397 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  24.44 
 
 		 457 aa  49.3  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 		 424 aa  49.3  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.93 
 
 		 398 aa  49.3  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  26.86 
 
 		 380 aa  49.3  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  25.24 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  30.06 
 
 		 462 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  33.63 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  31.62 
 
 		 408 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  34.03 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  33.93 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  30.65 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  44.16 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.39 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  56.1 
 
 		 463 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.84 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 		 389 aa  47.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  29.75 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1405  monooxygenase FAD-binding  27.56 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11161  oxidoreductase  42.5 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.264314 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>