More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1967 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1967  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 252 aa  507  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0876  resolvase domain-containing protein  77.29 
 
 		 251 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0740279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1963  resolvase domain-containing protein  76.49 
 
 		 251 aa  402  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0600134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0797  resolvase domain-containing protein  75.2 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000013388 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  38.06 
 
 		 230 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  32.95 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  32.12 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  31.68 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  30.77 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  27.96 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  28.1 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  30.58 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0721  resolvase domain-containing protein  32.68 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0556625 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  33.5 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  34.87 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  31.63 
 
 		 193 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  32.24 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2549  Resolvase domain protein  32.03 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0121219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  30.13 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  33.99 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  33.11 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  27.98 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  29.61 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  33.96 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  31.44 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  28.93 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  31.35 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  32.26 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  32.26 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  33.56 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0206  transposon resolvase  33.63 
 
 		 169 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000314886 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  27.67 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  29.85 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  29.85 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  24.62 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  29.67 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3075  resolvase domain protein  32.32 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  32.03 
 
 		 515 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  29.41 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  30.14 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  28.43 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  29.81 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  30.21 
 
 		 534 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  31.45 
 
 		 515 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  28 
 
 		 534 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  30.21 
 
 		 534 aa  59.3  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  29.69 
 
 		 534 aa  59.3  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  32.84 
 
 		 527 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  33.14 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  32.33 
 
 		 528 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  32.39 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  32.33 
 
 		 528 aa  58.9  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  30.9 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0254  resolvase domain-containing protein  28.65 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0277  resolvase domain-containing protein  28.65 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0887  resolvase domain-containing protein  28.65 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  29.33 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  31.03 
 
 		 525 aa  58.9  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  27.86 
 
 		 537 aa  58.9  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0073  resolvase domain-containing protein  28.65 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  31.45 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  30.1 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  27.86 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  26.49 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  28 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  29.69 
 
 		 537 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  26.47 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  32.56 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  28 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  32.12 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  27.55 
 
 		 183 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  27.55 
 
 		 183 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  25.26 
 
 		 189 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  31.65 
 
 		 511 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  27.03 
 
 		 199 aa  57  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  28.04 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0557  resolvase-like protein  32.8 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158765  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  30.13 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  39.33 
 
 		 518 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  39.33 
 
 		 518 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  30.64 
 
 		 525 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  38.1 
 
 		 539 aa  55.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  30.63 
 
 		 525 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  29.05 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  29.75 
 
 		 545 aa  55.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  28.87 
 
 		 522 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  28.87 
 
 		 415 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  28.66 
 
 		 188 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  26.13 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4198  resolvase domain-containing protein  25.5 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163134 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  30.19 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  30.61 
 
 		 474 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  27.78 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0830  Recombinase  38.1 
 
 		 534 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  29.11 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  29.11 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  29.11 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  31.44 
 
 		 380 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1402  Recombinase  36.9 
 
 		 534 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>