More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1948 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  67.66 
 
 
206 aa  289  3e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  32.49 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  37.33 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  33.75 
 
 
210 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1843  electron transport protein SCO1/SenC  32.92 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.607401 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  35.25 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  30.2 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  28.5 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  30.38 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  34.29 
 
 
206 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  33.08 
 
 
199 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  31.58 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  30.29 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  29.68 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0379  electron transport protein SCO1/SenC  33.58 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  37.86 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  33.76 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  32.91 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  29.2 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  30.92 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  32.03 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  27.88 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  34.04 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1986  electron transport protein SCO1/SenC  31.54 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  34.04 
 
 
198 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  31.55 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  33.59 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  28.24 
 
 
208 aa  67  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  31.72 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  30.87 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  30.2 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  31.5 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  32.81 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  35.84 
 
 
276 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  32.47 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  31.51 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  29.38 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  34.17 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1519  PrrC  34.17 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  38.32 
 
 
198 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1595  electron transport protein SCO1/SenC  31.73 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000402998  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  37.61 
 
 
204 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  27.59 
 
 
199 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  31.45 
 
 
208 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  30.19 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 
199 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1941  SCO1/SenC family protein  31.06 
 
 
180 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000240174  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  32.39 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2839  electron transport protein SCO1/SenC  27.4 
 
 
207 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.819932 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  22.44 
 
 
205 aa  63.2  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  35.07 
 
 
208 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  30.07 
 
 
190 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 
219 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 
219 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  34.71 
 
 
206 aa  62.8  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  31.34 
 
 
219 aa  62.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  30.52 
 
 
200 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  35.77 
 
 
215 aa  62.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  29.85 
 
 
171 aa  62.4  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  31.58 
 
 
193 aa  62.4  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  29.53 
 
 
197 aa  62.4  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
187 aa  62  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 
226 aa  62  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  33.59 
 
 
203 aa  62  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  38.38 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  32.64 
 
 
210 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  36.21 
 
 
181 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  32.47 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 
191 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  32.26 
 
 
211 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 
205 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  25.69 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  32.74 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  28.88 
 
 
219 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 
205 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  27.88 
 
 
194 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  30.82 
 
 
205 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  31.61 
 
 
205 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  31.61 
 
 
205 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  27.63 
 
 
209 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  35.34 
 
 
181 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  31.61 
 
 
205 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  35.34 
 
 
181 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  31.61 
 
 
205 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0037  electron transport protein SCO1/SenC  31.88 
 
 
214 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0273218  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  31.51 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  31.61 
 
 
205 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  31.97 
 
 
231 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0515097 
 
 
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NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  30.41 
 
 
228 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal 
 
 
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NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  34.19 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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