More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1946 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1946  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
279 aa  535  1e-151  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0310  protoheme IX farnesyltransferase  62.68 
 
 
278 aa  348  7e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.467497  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1811  protoheme IX farnesyltransferase  63.04 
 
 
278 aa  330  1e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.632186  normal  0.509325 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1923  protoheme IX farnesyltransferase  61.87 
 
 
279 aa  296  3e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0590  protoheme IX farnesyltransferase  62.32 
 
 
292 aa  292  4e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358239  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0520  protoheme IX farnesyltransferase  49.46 
 
 
286 aa  271  1e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2002  protoheme IX farnesyltransferase  35.23 
 
 
296 aa  145  8.000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1225  protoheme IX farnesyltransferase  32.98 
 
 
289 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  36.14 
 
 
622 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  35.86 
 
 
339 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  37.56 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  41.49 
 
 
302 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  37.86 
 
 
317 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1715  protoheme IX farnesyltransferase  38.39 
 
 
285 aa  123  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  34.72 
 
 
314 aa  123  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  36.84 
 
 
308 aa  122  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  33.09 
 
 
483 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  37.93 
 
 
328 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1588  protoheme IX farnesyltransferase  30.98 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  35.24 
 
 
317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 
321 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  34.38 
 
 
318 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 
302 aa  120  3e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  37.67 
 
 
333 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  33.84 
 
 
316 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  37.67 
 
 
333 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  37.67 
 
 
310 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  33.46 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  37.82 
 
 
304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  34.55 
 
 
295 aa  119  6e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  38.27 
 
 
294 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0096  protoheme IX farnesyltransferase  36.93 
 
 
299 aa  119  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  37.88 
 
 
326 aa  119  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  35.38 
 
 
321 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  32.64 
 
 
478 aa  118  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  34.14 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  30.74 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  36.98 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  34.9 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  34.04 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  31.56 
 
 
316 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  34.54 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  33.1 
 
 
535 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  34.03 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  36.08 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  33.89 
 
 
472 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  32.82 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  35.56 
 
 
312 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  37.76 
 
 
294 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2102  protoheme IX farnesyltransferase  37.98 
 
 
317 aa  116  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0306599  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  32.37 
 
 
301 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  36.95 
 
 
315 aa  115  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  32.75 
 
 
306 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  36 
 
 
294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  36.28 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 
482 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  34.74 
 
 
315 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  34.2 
 
 
301 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  31.74 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  37.81 
 
 
302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  36.59 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  32.86 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  38.78 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  38.65 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  30.5 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  37.9 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  32.64 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  34.15 
 
 
315 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  34.78 
 
 
323 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  39.52 
 
 
317 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  34.78 
 
 
323 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  34.15 
 
 
312 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  32.12 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  35.12 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  34.42 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  34.42 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  35.51 
 
 
302 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  34.23 
 
 
304 aa  112  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  34.98 
 
 
313 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  34.42 
 
 
312 aa  112  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 
353 aa  112  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  33.92 
 
 
311 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  35.75 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  32.64 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  32.64 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  32.96 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  36.32 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  37.06 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  33.77 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  32.64 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  35.1 
 
 
443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  35.32 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  35.38 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  34.21 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  32.64 
 
 
301 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  31.61 
 
 
300 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  31.61 
 
 
300 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  31.61 
 
 
300 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  32.64 
 
 
301 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  35.86 
 
 
324 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>