More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1809 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.03 
 
 
701 aa  721  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.14 
 
 
804 aa  698  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  64.49 
 
 
731 aa  924  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.97 
 
 
736 aa  731  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.27 
 
 
738 aa  721  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  91.98 
 
 
737 aa  1361  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.66 
 
 
754 aa  721  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.81 
 
 
773 aa  673  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  46.56 
 
 
804 aa  654  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  48.84 
 
 
721 aa  684  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.33 
 
 
801 aa  659  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.34 
 
 
772 aa  682  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.14 
 
 
709 aa  700  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  60.57 
 
 
760 aa  921  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.72 
 
 
757 aa  738  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.76 
 
 
740 aa  743  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  46.4 
 
 
703 aa  637  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.11 
 
 
730 aa  650  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  59.79 
 
 
768 aa  889  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.48 
 
 
742 aa  748  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.03 
 
 
784 aa  811  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.02 
 
 
810 aa  660  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.51 
 
 
806 aa  761  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.46 
 
 
757 aa  720  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  62.52 
 
 
732 aa  896  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  67.39 
 
 
718 aa  966  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  91.73 
 
 
738 aa  1356  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  66.39 
 
 
731 aa  942  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  51.04 
 
 
810 aa  741  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  51.3 
 
 
732 aa  692  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.77 
 
 
756 aa  759  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  56.63 
 
 
719 aa  811  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.51 
 
 
739 aa  759  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  65.44 
 
 
731 aa  931  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  100 
 
 
736 aa  1470  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.36 
 
 
805 aa  664  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.55 
 
 
704 aa  705  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.37 
 
 
808 aa  770  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.12 
 
 
754 aa  750  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.7 
 
 
753 aa  738  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.74 
 
 
740 aa  747  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  49.64 
 
 
826 aa  638  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  51.25 
 
 
718 aa  717  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  52.11 
 
 
763 aa  741  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  50 
 
 
713 aa  706  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.7 
 
 
800 aa  761  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  63.34 
 
 
735 aa  885  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  65.03 
 
 
731 aa  926  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.06 
 
 
755 aa  714  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  91.71 
 
 
737 aa  1338  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.29 
 
 
805 aa  702  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.81 
 
 
781 aa  814  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.02 
 
 
763 aa  712  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  75.11 
 
 
852 aa  1030  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.73 
 
 
754 aa  735  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.61 
 
 
801 aa  712  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  60.24 
 
 
769 aa  879  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  54.4 
 
 
754 aa  798  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  57.05 
 
 
738 aa  795  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  54.75 
 
 
722 aa  764  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.92 
 
 
757 aa  716  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  62.17 
 
 
759 aa  934  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.21 
 
 
715 aa  716  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  59.92 
 
 
727 aa  854  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.49 
 
 
743 aa  743  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.84 
 
 
781 aa  805  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  46.13 
 
 
814 aa  639  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.33 
 
 
754 aa  739  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.78 
 
 
721 aa  791  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  56.77 
 
 
723 aa  822  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  50.92 
 
 
764 aa  738  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  50.85 
 
 
775 aa  735  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.4 
 
 
742 aa  732  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  44.47 
 
 
810 aa  635  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  44.81 
 
 
829 aa  632  1e-180  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  43.81 
 
 
806 aa  619  1e-176  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  47.81 
 
 
703 aa  619  1e-176  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  45.11 
 
 
739 aa  602  1e-170  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  47.23 
 
 
746 aa  598  1e-169  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  45.28 
 
 
699 aa  582  1e-164  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  41.67 
 
 
930 aa  559  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  52.49 
 
 
639 aa  548  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  46.85 
 
 
685 aa  545  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  55 
 
 
776 aa  537  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  51.61 
 
 
613 aa  532  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  50.72 
 
 
647 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  53.33 
 
 
601 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  46.17 
 
 
788 aa  527  1e-148  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  46.59 
 
 
803 aa  518  1e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  48.4 
 
 
550 aa  512  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  45.68 
 
 
691 aa  490  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  47.07 
 
 
567 aa  476  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  40.5 
 
 
832 aa  464  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  40.54 
 
 
756 aa  442  1e-122  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  41.24 
 
 
729 aa  433  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  42.13 
 
 
607 aa  430  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  35.1 
 
 
748 aa  407  1e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  34.88 
 
 
749 aa  406  1e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  41.18 
 
 
599 aa  405  1e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40257  predicted protein  44.9 
 
 
537 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>