More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1778 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1778  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 
294 aa  589  1e-167  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000536627 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1590  dihydroorotate dehydrogenase  72.26 
 
 
295 aa  413  1e-114  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1692  dihydroorotate dehydrogenase  69.52 
 
 
297 aa  402  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.029227  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0507  dihydroorotate dehydrogenase  66.9 
 
 
296 aa  399  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.110855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  28.75 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0628  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.89 
 
 
352 aa  94.4  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  29.91 
 
 
377 aa  89.7  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.6 
 
 
336 aa  89.4  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.72 
 
 
336 aa  89.4  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0564  dihydroorotate oxidase  29.17 
 
 
322 aa  89.4  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0108543 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.95 
 
 
352 aa  87.8  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  30 
 
 
344 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.49 
 
 
331 aa  86.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1284  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.54 
 
 
344 aa  86.3  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.718117  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.62 
 
 
349 aa  86.7  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.16 
 
 
362 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0895  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.94 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.934158  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.54 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0825  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.94 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.454847  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1101  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.52 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  30 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.71 
 
 
362 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.49 
 
 
356 aa  84  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.64 
 
 
365 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.77 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.57 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.78 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.85 
 
 
352 aa  82  0.000000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.75 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.64 
 
 
352 aa  82  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.91 
 
 
335 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.3 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.05 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  29.29 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0581  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.84 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.76 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.83 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0940  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.49 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.365408  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.4 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.82 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.32 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.13 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.05 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.32 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.08 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.41 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.73 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.59 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1530  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.07 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.95205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.09 
 
 
358 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  27.97 
 
 
375 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.33 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  27.74 
 
 
356 aa  79  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.94 
 
 
353 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1784  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.09 
 
 
333 aa  79  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  30 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.66 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1074  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.86 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.5 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.5 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1554  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.86 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.69 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1056  dihydroorotate dehydrogenase  25.23 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.09 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1943  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.85 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.15 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.42 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.67 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  26.46 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.08 
 
 
339 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.86 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.54 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.17 
 
 
364 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.08 
 
 
351 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.05 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.72 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.08 
 
 
339 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.98 
 
 
363 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.08 
 
 
339 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.08 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.86 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  30.19 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0178  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.97 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.44 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  26.47 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.33 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.12 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0969  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.41 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0916684  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.08 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.3 
 
 
345 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  27.17 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.03 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1686  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.4 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.52 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.6 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.14 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.57 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.14 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.33 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.6 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>