30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1732 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1732  30S ribosomal protein S8e  100 
 
 		 131 aa  257  3e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.597289 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0575  30S ribosomal protein S8e  85.5 
 
 		 131 aa  224  3e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00513851 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1565  30S ribosomal protein S8e  85.5 
 
 		 131 aa  209  7e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1745  30S ribosomal protein S8e  82.44 
 
 		 131 aa  206  1e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179998  hitchhiker  0.00118469 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1630  30S ribosomal protein S8e  53.49 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.14774 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0358  30S ribosomal protein S8e  50.79 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.793187  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1141  ribosomal protein S8e  51.59 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0172  30S ribosomal protein S8e  52.8 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0667918  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1412  ribosomal protein S8e  47.29 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1338  30S ribosomal protein S8e  45.6 
 
 		 128 aa  96.7  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1516  30S ribosomal protein S8e  44.44 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.70504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1751  30S ribosomal protein S8e  42.06 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.606642  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0930  30S ribosomal protein S8e  40.48 
 
 		 128 aa  94  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.626224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1015  30S ribosomal protein S8e  40.48 
 
 		 128 aa  93.6  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.106071  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2485  30S ribosomal protein S8e  41.6 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0958  30S ribosomal protein S8e  42.06 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0469  30S ribosomal protein S8e  41.94 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.968411  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2307  30S ribosomal protein S8e  40.8 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1293  30S ribosomal protein S8e  42.74 
 
 		 127 aa  85.9  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000273371  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3465  30S ribosomal protein S8e  39.37 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0040135 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2101  30S ribosomal protein S8e  53.85 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0336  30S ribosomal protein S8e  39.68 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.691451 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0498  ribosomal protein S8e  41.53 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2474  ribosomal protein S8e  44.07 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0917  30S ribosomal protein S8e  42.42 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1797  ribosomal protein S8e  43.36 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.185164 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1967  30S ribosomal protein S8e  41.53 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.111484 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0520  30S ribosomal protein S8e  41.25 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71938  predicted protein  33.33 
 
 		 202 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29541  Ribosomal protein S8, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  31.63 
 
 		 220 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00746212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>