18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1731 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1731  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  100 
 
 		 97 aa  191  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.583276 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1746  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  64.58 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.100961  hitchhiker  0.00245079 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1566  ribonucleoprotein complex SRP, SRP19 component  62.11 
 
 		 95 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0576  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  64.21 
 
 		 95 aa  124  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00280682 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1273  signal recognition particle protein Srp19  39.58 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0367  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  37.11 
 
 		 100 aa  70.1  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  36.08 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.473363  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2116  signal recognition particle protein Srp19  31.25 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0004  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  35.23 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000181188  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1413  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  31.03 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2505  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  37.14 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2790  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  30.43 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1829  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  30.65 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2309  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  29.21 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0613645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0471  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  34.92 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0373645  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3604  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  28.85 
 
 		 93 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653493  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0477  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  29.21 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1560  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  32.08 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.972556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>