45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1697 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1697  glutaredoxin-like domain-containing protein  100 
 
 
243 aa  495  1e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000123601 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1569  glutaredoxin-like domain-containing protein  90.42 
 
 
243 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000134585 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1507  glutaredoxin-like domain-containing protein  87.08 
 
 
250 aa  425  1e-118  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.499765  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0614  glutaredoxin-like domain-containing protein  83.54 
 
 
244 aa  418  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000880654 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1343  glutaredoxin-like domain-containing protein  66.67 
 
 
249 aa  295  3e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000875988  normal  0.962499 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1173  glutaredoxin-like domain protein  39.22 
 
 
233 aa  159  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.545733  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0153  glutaredoxin-like domain-containing protein  42.92 
 
 
230 aa  157  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.369669  normal  0.0212592 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0326  glutaredoxin-like domain-containing protein  32.33 
 
 
255 aa  113  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0759  glutaredoxin-like domain protein  29.11 
 
 
227 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2537  glutaredoxin-like domain protein  34.09 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0059  glutaredoxin-like domain-containing protein  30.48 
 
 
221 aa  95.9  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000207157  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0059  glutaredoxin-like domain-containing protein  30.48 
 
 
221 aa  95.9  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000882966  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2049  glutaredoxin-like domain protein  31.47 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2727  dehydrogenase, selenocysteine-containing protein  26.87 
 
 
228 aa  92.4  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.305713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18130  glutaredoxin-like domain protein  30.53 
 
 
214 aa  92.4  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000620746  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2110  glutaredoxin-like domain protein  26.99 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.405211  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0021  glutaredoxin-like domain-containing protein  31.86 
 
 
225 aa  89  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2632  glutaredoxin-like domain protein  30.71 
 
 
227 aa  88.6  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1449  glutaredoxin-like domain protein  28.51 
 
 
221 aa  86.7  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3949  glutaredoxin-like domain-containing protein  29.87 
 
 
219 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0566  glutaredoxin-like domain-containing protein  27.51 
 
 
223 aa  85.9  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.443165  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0051  glutaredoxin-like domain protein  31.86 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  normal  0.790118 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.92 
 
 
551 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3623  glutaredoxin-like domain-containing protein  30.26 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0856  glutaredoxin-like domain-containing protein  29.46 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00205393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2897  glutaredoxin-like domain protein  37.41 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.422618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2804  glutaredoxin-like domain protein  37.41 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0554  glutaredoxin-like domain-containing protein  27.43 
 
 
220 aa  79  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.411962  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.78 
 
 
602 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.15 
 
 
547 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.9 
 
 
579 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1277  glutaredoxin-like domain protein  24.89 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  36.84 
 
 
550 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.31 
 
 
548 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0480  glutaredoxin-like domain protein  29.5 
 
 
187 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  23.56 
 
 
556 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1036  redox-active disulfide protein 1  37.93 
 
 
80 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0908  redox-active disulfide protein 1  35.63 
 
 
80 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1773  redox-active disulfide protein 1  35.63 
 
 
80 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1553  hypothetical protein  26.94 
 
 
187 aa  45.8  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0385592 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0503  redox-active disulfide protein 1  32.14 
 
 
82 aa  44.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0941  redox-active disulfide protein 1  35.8 
 
 
80 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.917441  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1632  thioredoxin domain-containing protein  25.46 
 
 
234 aa  42  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0209029  normal  0.101537 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  32.95 
 
 
109 aa  42.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1403  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  23.96 
 
 
525 aa  42  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>