More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1649 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  85.91 
 
 		 799 aa  1413    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  83.96 
 
 		 799 aa  1402    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 799 aa  1635    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 		 806 aa  983    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  85.09 
 
 		 799 aa  1418    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 771 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 858 aa  518  1.0000000000000001e-145  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 809 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 864 aa  483  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 886 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 855 aa  479  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 886 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 886 aa  478  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 865 aa  478  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 		 863 aa  473  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 906 aa  469  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 863 aa  464  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 865 aa  465  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 886 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 808 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 802 aa  450  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 		 869 aa  450  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 816 aa  442  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 865 aa  430  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 896 aa  427  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 808 aa  429  1e-118  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 		 881 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 		 908 aa  413  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  33.07 
 
 		 928 aa  405  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 		 905 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 892 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  34.84 
 
 		 836 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  35.03 
 
 		 886 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  33.42 
 
 		 846 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 855 aa  393  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 877 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 		 845 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 864 aa  389  1e-106  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  33.73 
 
 		 916 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 		 860 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 876 aa  382  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  33.84 
 
 		 858 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 		 882 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 		 894 aa  377  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  32.21 
 
 		 861 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 902 aa  375  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 		 906 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 881 aa  375  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 873 aa  375  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 		 895 aa  372  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  32.34 
 
 		 901 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 865 aa  369  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 865 aa  369  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 879 aa  365  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 885 aa  362  2e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 862 aa  361  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 872 aa  361  3e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 		 884 aa  360  4e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 881 aa  360  7e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  31.6 
 
 		 880 aa  359  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 881 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  32.34 
 
 		 874 aa  356  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  30.98 
 
 		 881 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 		 911 aa  350  6e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 891 aa  348  3e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 903 aa  347  4e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 885 aa  347  5e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  31.49 
 
 		 882 aa  346  8.999999999999999e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 		 883 aa  346  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 879 aa  345  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  31.53 
 
 		 925 aa  345  2.9999999999999997e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2238  valyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 		 884 aa  340  8e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.180056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 		 882 aa  339  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 881 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 		 867 aa  334  3e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  31.39 
 
 		 884 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 883 aa  333  8e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0251  valyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 886 aa  332  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 		 880 aa  331  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  30.58 
 
 		 892 aa  331  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 		 892 aa  331  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 		 880 aa  329  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 881 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 881 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 881 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 881 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 871 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 		 891 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 881 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 		 866 aa  327  5e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  31.32 
 
 		 887 aa  327  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 881 aa  326  9e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 904 aa  326  9e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 881 aa  326  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 881 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  30.9 
 
 		 861 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 881 aa  326  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  30.15 
 
 		 872 aa  325  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2765  valyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 		 883 aa  324  4e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.700056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 881 aa  323  6e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>