67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1637 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 795 aa  1523    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1444  SMC domain-containing protein  62.9 
 
 		 795 aa  931    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  60.43 
 
 		 790 aa  953    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  62.06 
 
 		 794 aa  939    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  29.38 
 
 		 805 aa  260  7e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  26.78 
 
 		 784 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  27.4 
 
 		 702 aa  104  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  23.38 
 
 		 858 aa  87  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  23.24 
 
 		 906 aa  76.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  24.47 
 
 		 702 aa  73.6  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  22.08 
 
 		 864 aa  71.6  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  24.36 
 
 		 891 aa  71.2  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  21.94 
 
 		 978 aa  70.5  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  30.84 
 
 		 700 aa  67  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  26.97 
 
 		 1019 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  24.3 
 
 		 804 aa  65.5  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  23.28 
 
 		 857 aa  65.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  28.83 
 
 		 702 aa  64.7  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  26.88 
 
 		 993 aa  64.3  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  22.84 
 
 		 926 aa  63.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  21.81 
 
 		 888 aa  63.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  22.77 
 
 		 483 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  28.42 
 
 		 813 aa  62.4  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  26.38 
 
 		 993 aa  61.6  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  25.95 
 
 		 994 aa  60.8  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  23.85 
 
 		 802 aa  60.5  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  26.38 
 
 		 993 aa  60.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  30.39 
 
 		 961 aa  60.1  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  28.08 
 
 		 987 aa  58.9  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  31.28 
 
 		 955 aa  57.8  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  29.86 
 
 		 987 aa  57.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1750  SMC domain protein  26.2 
 
 		 445 aa  55.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.524117  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  28.19 
 
 		 814 aa  55.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  26.45 
 
 		 910 aa  53.9  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  23.89 
 
 		 924 aa  53.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  22.91 
 
 		 642 aa  52.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1161  hypothetical protein  23 
 
 		 800 aa  52  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53629  DNA repair protein  22.44 
 
 		 1306 aa  52  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.440366 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  25.51 
 
 		 1020 aa  51.2  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  26.65 
 
 		 1019 aa  50.8  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  28.67 
 
 		 552 aa  50.8  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  26.19 
 
 		 1007 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  25.6 
 
 		 1172 aa  50.4  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  30.26 
 
 		 984 aa  50.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  21.05 
 
 		 1030 aa  50.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  21.8 
 
 		 935 aa  50.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  22.44 
 
 		 1049 aa  48.9  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  27.27 
 
 		 1074 aa  48.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  28.16 
 
 		 379 aa  48.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  28.07 
 
 		 676 aa  47.8  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  33.68 
 
 		 1007 aa  47  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  37.35 
 
 		 666 aa  46.6  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  25.25 
 
 		 1134 aa  46.6  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  24.44 
 
 		 1029 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  31.09 
 
 		 1178 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28736  predicted protein  26.71 
 
 		 1313 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  22.08 
 
 		 1108 aa  45.8  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  20.39 
 
 		 806 aa  45.4  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  25.49 
 
 		 371 aa  45.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  26.43 
 
 		 1061 aa  45.4  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  26.37 
 
 		 1025 aa  45.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  27.97 
 
 		 890 aa  44.7  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  22.53 
 
 		 1011 aa  44.3  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  23.94 
 
 		 1023 aa  44.3  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02963  subunit of the multiprotein cohesin complex (Eurofung)  36.62 
 
 		 1261 aa  44.3  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.869659  normal  0.319828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.71 
 
 		 397 aa  44.3  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  26.29 
 
 		 851 aa  44.3  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>