31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1602 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1602  archaemetzincin-like protein  100 
 
 
156 aa  319  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2061  archaemetzincin-like protein  68.92 
 
 
156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0828  archaemetzincin-like protein  66.89 
 
 
152 aa  196  9e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.687512  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0100  peptidase, zinc-dependent  43.7 
 
 
186 aa  97.4  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.92951  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1746  peptidase zinc-dependent  40.37 
 
 
180 aa  94  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0438  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  43.56 
 
 
202 aa  85.5  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1753  peptidase zinc-dependent  42 
 
 
175 aa  82  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0329  archaemetzincin-like protein  37.21 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3502  peptidase zinc-dependent  40.19 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1552  peptidase zinc-dependent  40.19 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1801  peptidase zinc-dependent  39.8 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.357683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1953  peptidase zinc-dependent  41.94 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.885912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1868  peptidase zinc-dependent  41.94 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0334  archaemetzincin-like protein  34.92 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.567826  normal  0.0385783 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2010  peptidase, zinc-dependent  41.13 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0307  peptidase zinc-dependent  37.21 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0006  peptidase zinc-dependent  39.42 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0006  Zn-dependent protease  39.42 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0829  peptidase, zinc-dependent  41.18 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.435908  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1076  peptidase, zinc-dependent  35.29 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.40633  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0006  peptidase zinc-dependent  38.78 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.655175  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0914  Zn-dependent proteases-like  31.61 
 
 
181 aa  67.4  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.134032  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1797  peptidase zinc-dependent  38.35 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0006  peptidase zinc-dependent  38.04 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2605  peptidase, zinc-dependent  38.95 
 
 
173 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2804  peptidase, zinc-dependent  36 
 
 
222 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1810  hypothetical protein  47.54 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.239997  hitchhiker  0.0000261346 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0593  hypothetical protein  29.21 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2945  hypothetical protein  37.33 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.120804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3039  hypothetical protein  37.33 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0615593  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2858  hypothetical protein  37.33 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00197139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>