33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1584 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1584  50S ribosomal protein L4P  100 
 
 
285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0814  50S ribosomal protein L4P  82.46 
 
 
284 aa  474  1e-133  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2047  50S ribosomal protein L4P  84.53 
 
 
278 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.758941 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1797  50S ribosomal protein L4P  85.25 
 
 
281 aa  461  1e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.300981  normal  0.693832 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0316  50S ribosomal protein L4P  59.18 
 
 
278 aa  308  8e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0229  50S ribosomal protein L4P  53.1 
 
 
267 aa  229  4e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1777  50S ribosomal protein L4P  45.56 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0792  50S ribosomal protein L4P  50.39 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0126736  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1126  50S ribosomal protein L4P  50.39 
 
 
252 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0806  50S ribosomal protein L4P  49.61 
 
 
252 aa  218  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0032  50S ribosomal protein L4P  49.61 
 
 
252 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.521177  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0858  50S ribosomal protein L4P  49.21 
 
 
252 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0109  50S ribosomal protein L4P  45.45 
 
 
253 aa  205  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0092  50S ribosomal protein L4P  44.62 
 
 
263 aa  204  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000165336  unclonable  0.000000383631 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0002  50S ribosomal protein L4P  45.67 
 
 
253 aa  202  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000396442  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2448  50S ribosomal protein L4P  47.58 
 
 
248 aa  201  8e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1727  50S ribosomal protein L4P  46 
 
 
251 aa  201  8e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0211  50S ribosomal protein L4P  44.76 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2219  50S ribosomal protein L4P  45.16 
 
 
250 aa  196  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0565  50S ribosomal protein L4P  46.4 
 
 
249 aa  195  6e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0533  50S ribosomal protein L4P  45.02 
 
 
248 aa  194  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.434154  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2252  50S ribosomal protein L4P  44.62 
 
 
249 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000000213252  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2293  50S ribosomal protein L4P  44.9 
 
 
247 aa  187  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0082  50S ribosomal protein L4P  46.8 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.182582 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13310  predicted protein  40.77 
 
 
387 aa  181  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.600406 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1829  ribosomal protein L4/L1e  43.27 
 
 
247 aa  178  8e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0443  50S ribosomal protein L4P  42.57 
 
 
249 aa  170  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74639  predicted protein  41.37 
 
 
363 aa  164  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.108089  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51018  predicted protein  38.13 
 
 
397 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322976  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01920  Ras2, putative  37.74 
 
 
363 aa  149  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0808  50S ribosomal protein L4P  39.92 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.493543 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1520  50S ribosomal protein L4P  39.44 
 
 
254 aa  145  8.000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000105309  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08176  60S ribosomal protein L4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03020)  37.45 
 
 
372 aa  142  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>