More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1577 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1577  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
427 aa  860    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.5 
 
 
431 aa  375  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0678003 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0406  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.5 
 
 
431 aa  373  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0694601 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1299  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.62 
 
 
419 aa  327  3e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0594  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.51 
 
 
446 aa  270  4e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1633  hypothetical protein  26.73 
 
 
459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1267  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.54 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1376  heterodisulfide reductase  25.35 
 
 
420 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0673613  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1188  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  26.84 
 
 
457 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4179  hypothetical protein  24.34 
 
 
515 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0899  hypothetical protein  24.82 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1333  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.57 
 
 
505 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265785 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1534  hypothetical protein  23.83 
 
 
446 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3285  iron-sulfur cluster-binding protein  23.68 
 
 
453 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2883  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.68 
 
 
453 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  24.71 
 
 
412 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0034  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.51 
 
 
466 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0249  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.46 
 
 
537 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0076  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.18 
 
 
454 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  25.34 
 
 
409 aa  96.7  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2437  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  27.74 
 
 
415 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0851  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.38 
 
 
493 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0339  hypothetical protein  25.11 
 
 
534 aa  92.4  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.495442  normal  0.0503197 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0947  Fe-S oxidoreductase-like protein  23.38 
 
 
400 aa  91.7  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.118909  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.11 
 
 
534 aa  90.9  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2192  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  24.77 
 
 
496 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0574  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.21 
 
 
531 aa  90.1  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.158943  normal  0.0218676 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2272  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  23.42 
 
 
536 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0038  DsrK protein  24.18 
 
 
549 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4054  hypothetical protein  26.77 
 
 
632 aa  89  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363818  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0085  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25 
 
 
489 aa  88.2  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52676  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2714  hypothetical protein  24.88 
 
 
439 aa  87  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3709  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  23.89 
 
 
439 aa  86.3  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1776  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  23.9 
 
 
536 aa  86.3  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.279132  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.47 
 
 
679 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3299  hypothetical protein  25.39 
 
 
639 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753442  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0744  ptuative iron-sulfur cluster-binding protein  25.71 
 
 
641 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2191  hypothetical protein  21.94 
 
 
461 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0704  DsrK protein  23.35 
 
 
549 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186975  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.55 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.742352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3198  hypothetical protein  20.52 
 
 
464 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1348  hypothetical protein  21.75 
 
 
617 aa  84  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0839  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.84 
 
 
533 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00734731  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5067  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.88 
 
 
637 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.010013 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0069  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  22.53 
 
 
536 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.481368 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0475  iron-sulfur cluster binding protein  25.39 
 
 
641 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.654779  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2111  iron-sulfur cluster binding protein  25.39 
 
 
641 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1864  iron-sulfur cluster binding protein  25.39 
 
 
641 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1581  hypothetical protein  26.02 
 
 
637 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370419  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0832  ptuative iron-sulfur cluster-binding protein  25.39 
 
 
641 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1975  iron-sulfur cluster binding protein  25.39 
 
 
641 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1002  iron-sulfur cluster binding protein  25.39 
 
 
641 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0706  iron-sulfur cluster binding protein  25.39 
 
 
641 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0050  Fe-S oxidoreductase  21.99 
 
 
500 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00237763  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.29 
 
 
629 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1606  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.89 
 
 
541 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02034  hypothetical protein  25.08 
 
 
641 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365168 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0236  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.8 
 
 
534 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.942909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4781  4Fe-4S ferredoxin  25.31 
 
 
654 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1848  DsrK protein  22.99 
 
 
549 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.189216  normal  0.170119 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0220  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  26.37 
 
 
487 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.804076  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2478  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  22.58 
 
 
507 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5222  hypothetical protein  25.84 
 
 
649 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064431  hitchhiker  0.00288183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1446  hypothetical protein  22.71 
 
 
542 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0311  iron-sulfur cluster-binding protein  26.32 
 
 
650 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0857951  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2555  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.94 
 
 
445 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0334  hypothetical protein  25.8 
 
 
650 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0384871  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2312  DsrK protein  23.4 
 
 
550 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0045  DsrK protein  23.08 
 
 
549 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0403  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  26.01 
 
 
490 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.864832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0332  hypothetical protein  25.51 
 
 
650 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0251968  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0137  DsrK protein  22.59 
 
 
549 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.258854  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4896  hypothetical protein  26.02 
 
 
650 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395203  normal  0.74481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0257  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.31 
 
 
542 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0999  hypothetical protein  26.44 
 
 
615 aa  77.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0267446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0991  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  24.6 
 
 
670 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.996446  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0271  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.37 
 
 
543 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000185698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1147  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.2 
 
 
539 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63071  normal  0.964876 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  23.26 
 
 
683 aa  77  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1028  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  20.95 
 
 
451 aa  77  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3052  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  26.05 
 
 
481 aa  77  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0461  hypothetical protein  22.63 
 
 
703 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.667458  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3550  hypothetical protein  25.39 
 
 
641 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5018  hypothetical protein  25.39 
 
 
641 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646307  normal  0.216934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6186  putative ferredoxin  24.64 
 
 
658 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4493  hypothetical protein  25.39 
 
 
641 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  22.51 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0302  hypothetical protein  22.31 
 
 
444 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0397  iron-sulfur cluster-binding protein  25.15 
 
 
669 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138484  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4818  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.09 
 
 
641 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162779  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2723  hypothetical protein  25.47 
 
 
641 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0494  hypothetical protein  24.93 
 
 
653 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1219  hypothetical protein  24.37 
 
 
490 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.158423  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0971  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.18 
 
 
723 aa  74.7  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0575  hypothetical protein  25.08 
 
 
641 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  23.65 
 
 
692 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25.59 
 
 
494 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.573606  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  24.41 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1282  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.68 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.438227 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0545  hypothetical protein  25.33 
 
 
588 aa  73.9  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>