54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1549 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1549  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  100 
 
 
216 aa  441  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0018  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  63.18 
 
 
209 aa  264  8.999999999999999e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.840157  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  60.7 
 
 
209 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1047  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  56.8 
 
 
211 aa  245  3e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.376567  normal  0.793229 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1765  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  35.11 
 
 
216 aa  122  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4048  phosphotransferase KptA/Tpt1  35.56 
 
 
182 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.624394  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2734  phosphotransferase KptA/Tpt1  39.77 
 
 
180 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5513  putative RNA 2'-phosphotransferase  37.85 
 
 
187 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0209017  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04510  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  40.35 
 
 
180 aa  115  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350174  hitchhiker  0.00000275449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0962  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  33.33 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0145  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  36.67 
 
 
186 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.71719  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5352  phosphotransferase KptA/Tpt1  40 
 
 
182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.74919  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0143  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  35.56 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.264895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5718  phosphotransferase KptA/Tpt1  39.52 
 
 
174 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0748  phosphate acetyltransferase  36.47 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.325809  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1795  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  38.46 
 
 
194 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0075  phosphotransferase KptA/Tpt1  32.58 
 
 
180 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4639  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  36.47 
 
 
182 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000460049  normal  0.20738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3205  phosphotransferase KptA/Tpt1  33.53 
 
 
184 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  hitchhiker  0.000000000338046 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6764  phosphate acetyltransferase  33.86 
 
 
211 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534993  normal  0.870017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4788  RNA 2'-phosphotransferase  36.26 
 
 
187 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2451  phosphotransferase KptA/Tpt1  37.95 
 
 
176 aa  105  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  hitchhiker  0.000000261836 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1409  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  34.16 
 
 
215 aa  104  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1806  phosphate acetyltransferase  37.79 
 
 
179 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.825619  normal  0.0231057 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3059  phosphotransferase KptA/Tpt1  35.47 
 
 
182 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0438  phosphotransferase KptA/Tpt1  36.05 
 
 
180 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4774  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  38.79 
 
 
184 aa  101  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18720  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  38 
 
 
215 aa  101  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.635673  normal  0.289098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4559  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  38.18 
 
 
184 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00660  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  38.55 
 
 
182 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3135  phosphotransferase KptA/Tpt1  33.54 
 
 
180 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0177  phosphotransferase KptA/Tpt1  39.11 
 
 
177 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3665  Phosphate acetyltransferase  38.18 
 
 
184 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000562336  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0908  phosphotransferase KptA/Tpt1  32.81 
 
 
253 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2868  phosphate acetyltransferase  35.54 
 
 
181 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.784433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04200  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  38.18 
 
 
184 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000393415  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0054  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  38.55 
 
 
182 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  38.18 
 
 
184 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04163  hypothetical protein  38.18 
 
 
184 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000225053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4875  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  37.58 
 
 
194 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2777  RNA 2'-phosphotransferase  35.03 
 
 
185 aa  99.4  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000161899  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0729  phosphotransferase KptA/Tpt1  30.34 
 
 
192 aa  99  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5760  phosphate acetyltransferase  38.1 
 
 
394 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0192173  hitchhiker  0.0000000000000462587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4889  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  33.71 
 
 
182 aa  96.7  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0381  phosphotransferase KptA/Tpt1  36.31 
 
 
186 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5516  Phosphate acetyltransferase  34.52 
 
 
180 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.16983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2545  RNA 2'-phosphotransferase  30.11 
 
 
195 aa  95.5  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0527  phosphotransferase KptA/Tpt1  37.79 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2307  phosphotransferase KptA/Tpt1  32.07 
 
 
201 aa  92  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.545628  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2137  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  32.18 
 
 
184 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0213319  normal  0.0608547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1928  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  32.75 
 
 
184 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507993  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56016  predicted protein  28.32 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.047688 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0839  phosphotransferase KptA/Tpt1  28.93 
 
 
247 aa  48.5  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21228  predicted protein  24.76 
 
 
225 aa  42.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>