More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1518 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1518  transport system permease protein  100 
 
 
306 aa  570  1e-161  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  4.31091e-11 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1955  transport system permease protein  60.33 
 
 
307 aa  281  8e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.443661  hitchhiker  1.24835e-18 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1092  transport system permease protein  64.14 
 
 
307 aa  265  6e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00868751  hitchhiker  0.00152758 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2137  transport system permease protein  58.25 
 
 
307 aa  264  1e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1257  transport system permease protein  32.07 
 
 
348 aa  122  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0747  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  24.83 
 
 
343 aa  113  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  30.77 
 
 
323 aa  111  2e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  29.02 
 
 
322 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  31.74 
 
 
340 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  28.77 
 
 
322 aa  106  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  30.53 
 
 
329 aa  106  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0039  transport system permease protein  28.42 
 
 
336 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00235157  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  34.11 
 
 
337 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  31.86 
 
 
344 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  31.53 
 
 
344 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  5.99785e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  31.49 
 
 
354 aa  102  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  30.69 
 
 
340 aa  102  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  29.55 
 
 
374 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  31.69 
 
 
343 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0162  transport system permease protein  30.58 
 
 
359 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2111  transport system permease protein  29.24 
 
 
391 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.453774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  30.95 
 
 
356 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  28.71 
 
 
331 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  30.8 
 
 
350 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  33.33 
 
 
346 aa  99.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  27.92 
 
 
330 aa  99  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  27.21 
 
 
330 aa  99.4  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2065  transport system permease protein  35.37 
 
 
332 aa  99.4  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  33.33 
 
 
347 aa  99  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  33.11 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  30.58 
 
 
339 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.05 
 
 
704 aa  99  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  31.25 
 
 
343 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2739  transport system permease protein  36.8 
 
 
327 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246804  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4223  transport system permease protein  36.69 
 
 
346 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  33.33 
 
 
332 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  35.74 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  31.01 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4340  iron ABC transporter, permease protein FitD  31.36 
 
 
345 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  29.71 
 
 
359 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0583  iron compound ABC transporter, permease protein  28.28 
 
 
327 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4654  iron compound ABC transporter, permease protein  28.28 
 
 
327 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  33.43 
 
 
357 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.87 
 
 
694 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  30.72 
 
 
355 aa  97.4  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  31.85 
 
 
371 aa  97.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  31.69 
 
 
352 aa  97.1  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  28.97 
 
 
336 aa  97.1  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4279  iron compound ABC transporter, permease  28.28 
 
 
327 aa  96.3  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.551381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4659  iron compound ABC transporter, permease protein  28.28 
 
 
327 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4290  iron compound ABC transporter, permease  28.28 
 
 
327 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4672  iron compound ABC transporter, permease protein  27.93 
 
 
327 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  27.4 
 
 
337 aa  96.3  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.07964e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  35.11 
 
 
360 aa  95.9  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  31.27 
 
 
363 aa  95.9  7e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  31.35 
 
 
336 aa  95.9  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  28.72 
 
 
328 aa  95.9  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  33.33 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  28.62 
 
 
347 aa  95.1  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4440  iron compound ABC transporter permease  27.93 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4785  iron compound ABC transporter permease protein  27.93 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0304  transport system permease protein  36.44 
 
 
369 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  30.89 
 
 
363 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  32.74 
 
 
361 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2634  iron chelate ABC transporter permease protein  29.79 
 
 
352 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.12766e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2719  transport system permease protein  31.45 
 
 
352 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  7.28456e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  30.53 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  29.73 
 
 
348 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  32.28 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2248  transport system permease protein  33.56 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  35.1 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  28.47 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  30.53 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  30.53 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  28.1 
 
 
356 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  30.12 
 
 
370 aa  94  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3320  iron ABC transporter, permease protein FitD  31.01 
 
 
349 aa  94  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0698736 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  29.68 
 
 
346 aa  94  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  30 
 
 
363 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  29.49 
 
 
349 aa  94  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4373  transport system permease protein  27.59 
 
 
327 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4669  iron compound ABC transporter, permease protein  27.93 
 
 
327 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  28.97 
 
 
327 aa  93.6  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  30.82 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  33.91 
 
 
370 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  30.82 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  30.58 
 
 
315 aa  93.2  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  1.18421e-05  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  33.79 
 
 
336 aa  93.2  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  29.86 
 
 
372 aa  93.2  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  1.01745e-09 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  28.57 
 
 
368 aa  93.2  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  31.82 
 
 
336 aa  93.2  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  30.25 
 
 
340 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3337  transport system permease protein  29.75 
 
 
340 aa  92.4  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.66 
 
 
709 aa  92.4  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.119028  normal  0.926797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  29.43 
 
 
336 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  31.49 
 
 
369 aa  92.4  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  28.19 
 
 
347 aa  92.4  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0100  transport system permease protein  27.76 
 
 
332 aa  92.4  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0102196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0104  transport system permease protein  27.76 
 
 
332 aa  92.4  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000364541  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  29.05 
 
 
348 aa  92.4  8e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>