17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1516 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1516  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  365  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  3.03236e-11 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1148  hypothetical protein  41.82 
 
 
220 aa  115  6e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0283624 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1705  hypothetical protein  40.37 
 
 
271 aa  99  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.594083  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2214  Protein of unknown function DUF1626  37.78 
 
 
324 aa  91.7  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.346071  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  33.08 
 
 
380 aa  77.8  8e-14  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1548  hypothetical protein  31.02 
 
 
219 aa  63.2  3e-09  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1768  hypothetical protein  33.58 
 
 
385 aa  61.2  8e-09  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0460  hypothetical protein  66.67 
 
 
212 aa  55.1  6e-07  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1685  hypothetical protein  62.79 
 
 
386 aa  52.4  5e-06  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  1.83285e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1898  hypothetical protein  29.67 
 
 
284 aa  48.5  6e-05  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0419  hypothetical protein  31.01 
 
 
270 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1920  hypothetical protein  28.7 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1170  hypothetical protein  28.24 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0259926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4195  Protein of unknown function DUF1626  26.04 
 
 
274 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4234  Protein of unknown function DUF1626  26.04 
 
 
274 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713655 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  31.41 
 
 
242 aa  42.4  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0991  hypothetical protein  27.56 
 
 
241 aa  42  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.95618  normal  0.04449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>