More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1479 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  100 
 
 		 126 aa  250  5.000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  70.63 
 
 		 135 aa  193  7e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  58.68 
 
 		 139 aa  160  6e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  59.02 
 
 		 139 aa  160  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  55.56 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  57.85 
 
 		 139 aa  135  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  47.54 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  45.45 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  42.98 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  46.28 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  44.07 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  46.28 
 
 		 136 aa  99.4  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  40.8 
 
 		 139 aa  97.1  8e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  41.32 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  42.15 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  45.76 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  42.62 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  40.68 
 
 		 136 aa  90.9  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  42.62 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  38.33 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  38.33 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  41.74 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  36.67 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  37.4 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  39.34 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  38.4 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  41.53 
 
 		 688 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  37.82 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  34.19 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  39.64 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  36.89 
 
 		 688 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  36.89 
 
 		 688 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  36.13 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  36.97 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  40.48 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  38.39 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  33.88 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  36.89 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  36.44 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  35.9 
 
 		 646 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  40 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  37.29 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  30 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  35 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  36.94 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.91 
 
 		 504 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  38.02 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  35.04 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  34.51 
 
 		 177 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  33.06 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0638  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.61 
 
 		 504 aa  63.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.726913  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.04 
 
 		 493 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.17 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  31.97 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.97 
 
 		 507 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  38.33 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  40.54 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  35.94 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  30.58 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.97 
 
 		 490 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 		 643 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.04 
 
 		 491 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  40 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  35.51 
 
 		 689 aa  60.8  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  38.21 
 
 		 663 aa  60.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.9 
 
 		 488 aa  60.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.58 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  36.21 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  33.06 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  30.43 
 
 		 399 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  33.59 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.51 
 
 		 485 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  32.8 
 
 		 622 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  32.79 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  28.28 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  34.68 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  28.23 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  38.74 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1949  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.04 
 
 		 485 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.36 
 
 		 488 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  38.05 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  32.23 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  36.28 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.45 
 
 		 485 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  36.28 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.45 
 
 		 488 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  29.51 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.14 
 
 		 485 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1806  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.21 
 
 		 574 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>