274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1466 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  100 
 
 		 81 aa  159  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  78.26 
 
 		 82 aa  114  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  57.53 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  45.21 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  42.47 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0858  SirA family protein  40.28 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  42.86 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  41.1 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  41.1 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  42.86 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  41.1 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  42.25 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  35.62 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  39.44 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  28.95 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  28.95 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  28.95 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  28.95 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  39.13 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  36 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  35.21 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  45.45 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  38.89 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  44.93 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  41.43 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  33.8 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  41.79 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  39.13 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  39.13 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  39.13 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  49.06 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  39.13 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  39.13 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  39.13 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  39.13 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  39.13 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  39.13 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  39.13 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  39.13 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  39.13 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  32.88 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0894  SirA family protein  43.06 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  34.72 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  41.54 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  41.54 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  41.54 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  36.59 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  43.64 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0828  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  46.15 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  39.68 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  43.64 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  41.43 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  43.64 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  40 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  43.64 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  42.25 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  35.06 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  43.64 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  43.64 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  43.64 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  43.64 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  38.89 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  39.13 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0830  SirA family protein  35.62 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.183754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  38.89 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  38.1 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  34.72 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  37.5 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1763  SirA family protein  38.03 
 
 		 181 aa  51.2  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  39.44 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  34.33 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  36.62 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  34.72 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  37.5 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  40.3 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 184 aa  50.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  36.11 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  40.3 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  39.44 
 
 		 75 aa  50.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  42.11 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  38.03 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  34.78 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  36.62 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0062  SirA family protein  35.21 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  37.68 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  44.07 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  42.31 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  35.21 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  39.13 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  35.71 
 
 		 74 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  37.68 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  32.35 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  35.21 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  35.21 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1262  SirA family protein  38.03 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  35.71 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  34.29 
 
 		 73 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  36.11 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>