84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1458 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1458  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 269 aa  541  1e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1214  uroporphyrinogen III synthase HEM4  43.97 
 
 		 281 aa  203  3e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2335  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.68 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00840  uroporphyrinogen-III synthase  29.81 
 
 		 377 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0880377  normal  0.206146 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2199  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.22 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0253  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  32.89 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2796  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.45 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507836  decreased coverage  0.000543328 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0672  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.45 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947107 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1707  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.35 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1775  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.67 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.488954  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0263  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  32.44 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0273  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  32.44 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92823  normal  0.27348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3043  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.62 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0301  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  34.8 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1377  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.66 
 
 		 378 aa  79.3  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2410  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.89 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000187789  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0380  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  33.22 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1813  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.54 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0320621  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1303  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  26.34 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000592794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1494  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  29.1 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5922  Uroporphyrinogen-III synthase-like protein  29.52 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0915623  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1256  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  25.19 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1742  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  32.51 
 
 		 435 aa  72.8  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.849504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2720  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.45 
 
 		 368 aa  72  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.210642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1576  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.27 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.36 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0793  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  28.52 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.57 
 
 		 391 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4262  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  27.68 
 
 		 362 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2282  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.49 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000232035  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0840  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.55 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000157223  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5710  putative uroporphyrinogen-III synthase  27.27 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2449  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.18 
 
 		 502 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.448467  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.2 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000567169  hitchhiker  0.00000562153 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.76 
 
 		 497 aa  62.4  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3476  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.05 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4563  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.59 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2963  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.24 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1325  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  27.76 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1109  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.64 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  23.65 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.48 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0354  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  29.85 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.36 
 
 		 519 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1428  uroporphyrinogen-III synthase  25.6 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4165  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.85 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0287  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.64 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.437288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  23.17 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.82 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0028  Uroporphyrinogen-III synthase  27.75 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  27.62 
 
 		 513 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0052  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.6 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.36 
 
 		 503 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02870  uroporphyrinogen-III synthase /uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.42 
 
 		 516 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.052713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2640  uroporphyrinogen-III synthase  26.56 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  25.29 
 
 		 505 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.95 
 
 		 512 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  30.66 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  23.51 
 
 		 516 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.71 
 
 		 510 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.73 
 
 		 579 aa  50.4  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2288  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.24 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.17 
 
 		 504 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0493  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.19 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3677  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.69 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1514  uroporphyrinogen-III synthase  24.02 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.58 
 
 		 504 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  23.74 
 
 		 520 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.58 
 
 		 509 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2689  uroporphyrinogen-III synthase  30.24 
 
 		 260 aa  46.6  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0949  Uroporphyrinogen-III synthase  22.96 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.49 
 
 		 503 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1792  uroporphyrinogen-III synthase  19.75 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.156972  normal  0.974342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6728  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  24.17 
 
 		 510 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  24.9 
 
 		 513 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.72 
 
 		 507 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.02 
 
 		 508 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1526  uroporphyrinogen-III synthase  25.51 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000060174  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.82 
 
 		 506 aa  43.5  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1278  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.22 
 
 		 504 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.62 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2491  uroporphyrinogen-III synthase  45 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31 
 
 		 507 aa  42.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1376  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.64 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95913  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>