More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1395 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  100 
 
 		 141 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  50.34 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  49.25 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  49.28 
 
 		 141 aa  130  9e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  44.44 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  52.27 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  45.93 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  45.19 
 
 		 141 aa  123  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  46.27 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  51.2 
 
 		 136 aa  120  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  45.14 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  45.59 
 
 		 138 aa  102  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  44.44 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  42.65 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  37.88 
 
 		 160 aa  93.6  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  44.78 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  39.71 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  39.52 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  39.57 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  42.5 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  42.34 
 
 		 688 aa  87.8  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  42.5 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  32.33 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  35.45 
 
 		 688 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  39.69 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  39.17 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  39.34 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  42.15 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  35.45 
 
 		 688 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 		 618 aa  80.9  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  36.97 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  40.54 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  33.62 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  40.54 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.79 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  36.08 
 
 		 689 aa  78.2  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  38.64 
 
 		 242 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  43.56 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  37.72 
 
 		 624 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  34.45 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  39.17 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  33.62 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  34.33 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1855  CBS domain-containing protein  51.85 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  38.32 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  37.29 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  45.54 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  38.14 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  34.71 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  36.69 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  32.38 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  40.59 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  38.14 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  34.75 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  36.89 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  37.29 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2198  signal-transduction protein  43.43 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0268449  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  34.75 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 623 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  32.59 
 
 		 629 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  31.67 
 
 		 626 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  37.29 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  40.62 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 626 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  38.3 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  39.81 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  33.83 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  31.93 
 
 		 615 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  39.81 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  32.17 
 
 		 637 aa  67.8  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  38.61 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  36.72 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  28.23 
 
 		 625 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  31.39 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  37.04 
 
 		 158 aa  67  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2970  signal-transduction protein  37.38 
 
 		 187 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  29.91 
 
 		 615 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  37.25 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  39.81 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.03 
 
 		 605 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  33.9 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  36.84 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  36.84 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  31.97 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  32.23 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  37.62 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  37.25 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  39.22 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  39.6 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  37.96 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  41.35 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  41.35 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.22 
 
 		 498 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  35.78 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1594  CBS domain-containing protein  40.62 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0792656  normal  0.0914087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>