More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1359 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0594  glycosyl transferase, group 1  86.03 
 
 
401 aa  719    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1359  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
402 aa  825    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.254886 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0419  glycosyl transferase group 1  65.09 
 
 
413 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.102155  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0129  glycosyl transferase, group 1  66.92 
 
 
397 aa  563  1.0000000000000001e-159  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.730138  hitchhiker  0.000955625 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1740  glycosyl transferase group 1  51.9 
 
 
411 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163685 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2083  glycosyl transferase, group 1  51.9 
 
 
411 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3111  trehalose phosphorylase/synthase  52.15 
 
 
420 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0797  glycosyl transferase, group 1  50.51 
 
 
408 aa  397  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2348  glycosyl transferase, group 1  50.87 
 
 
411 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0363579  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0297  glycosyl transferase group 1  49.75 
 
 
411 aa  389  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1718  glycosyl transferase group 1  47.47 
 
 
433 aa  384  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1592  glycosyl transferase, group 1  45.41 
 
 
414 aa  359  5e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5908  glycosyl transferase group 1  46.43 
 
 
410 aa  345  6e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3082  glycosyl transferase, group 1  48.95 
 
 
474 aa  342  8e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1812  glycosyl transferase, group 1  44.89 
 
 
407 aa  341  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0100815  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2023  glycosyl transferase, group 1  44.72 
 
 
442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0528  glycosyl transferase, group 1  45.32 
 
 
406 aa  335  9e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000105595  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0542  glycosyl transferase group 1  45.06 
 
 
406 aa  334  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000128948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2973  glycosyl transferase, group 1  48.2 
 
 
416 aa  333  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1763  glycosyl transferase, group 1  42.82 
 
 
419 aa  324  2e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.410209  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1821  glycosyl transferase, group 1  41.33 
 
 
403 aa  319  7e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0709671  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  42.13 
 
 
410 aa  318  9e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0451  glycosyl transferase group 1  40.3 
 
 
406 aa  317  3e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.340856  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3832  glycosyl transferase group 1  39.95 
 
 
417 aa  289  5.0000000000000004e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0427  glycosyl transferase group 1  41.03 
 
 
460 aa  288  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.049978  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1550  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 
398 aa  262  6.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.267317  hitchhiker  0.0000000000000568319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4094  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
509 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108712  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3637  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
497 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.564588 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04480  trehalose synthase, putative  30.67 
 
 
734 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05021  trehalose synthase (Ccg-9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12100)  26.65 
 
 
705 aa  99  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.54 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.31 
 
 
367 aa  67  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  30.77 
 
 
420 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
374 aa  66.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  23.51 
 
 
383 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  27.64 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
413 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
748 aa  63.2  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119517  glycosyl transferase, putative alpha-1,3-mannosyltransferase  28.02 
 
 
480 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2581  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
421 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170764  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22554  mannosyltransferase  42.86 
 
 
419 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
384 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
406 aa  61.6  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
821 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.02 
 
 
381 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
434 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
408 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
378 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
376 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
819 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
384 aa  59.7  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.02 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  28.02 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  28.02 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.02 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
416 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.02 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  28.02 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
420 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
377 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
426 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.47 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.84 
 
 
365 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
424 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
421 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  29.33 
 
 
362 aa  57.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
374 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 
386 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  26.55 
 
 
408 aa  57.4  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.49 
 
 
423 aa  57.4  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 
822 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 
384 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1590  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 
468 aa  57  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00816719  decreased coverage  0.0063014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  38.67 
 
 
384 aa  57  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
361 aa  57  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
440 aa  57  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  27.93 
 
 
650 aa  56.6  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  29.05 
 
 
426 aa  56.2  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.47 
 
 
381 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 
422 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
821 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  27.41 
 
 
413 aa  56.2  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1311  glycosyl transferase group 1  38.3 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  24.9 
 
 
379 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
384 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 
379 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
500 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  30.51 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3925  group 1 glycosyl transferase  26.35 
 
 
421 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  26.25 
 
 
432 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
381 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3483  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0885784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>