More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1344 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  82.68 
 
 
492 aa  818  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  83.3 
 
 
492 aa  823  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  100 
 
 
491 aa  979  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  85.53 
 
 
311 aa  556  1e-157  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  41.39 
 
 
510 aa  370  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  38.92 
 
 
489 aa  368  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  33.98 
 
 
558 aa  291  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  37.66 
 
 
556 aa  291  2e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  39.51 
 
 
519 aa  290  3e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  35.15 
 
 
542 aa  290  4e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  35.95 
 
 
654 aa  290  4e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  32.24 
 
 
549 aa  286  5e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  34.85 
 
 
628 aa  283  6e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  36.89 
 
 
551 aa  283  6e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  35.05 
 
 
547 aa  276  5e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  37.35 
 
 
591 aa  276  9e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  33.19 
 
 
609 aa  272  9e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  36.45 
 
 
671 aa  270  3e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  32.29 
 
 
549 aa  270  4e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  37.78 
 
 
547 aa  270  5e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  32.08 
 
 
545 aa  267  4e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  33.2 
 
 
572 aa  265  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  35.03 
 
 
583 aa  264  3e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  33.48 
 
 
682 aa  261  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  32.05 
 
 
749 aa  258  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  35.03 
 
 
557 aa  258  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  34.27 
 
 
577 aa  258  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  31.68 
 
 
640 aa  258  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  34.08 
 
 
546 aa  258  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  32.02 
 
 
722 aa  256  8e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  33.89 
 
 
604 aa  254  2e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  33.61 
 
 
546 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  35.13 
 
 
546 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  31.2 
 
 
797 aa  254  4e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  31.85 
 
 
791 aa  253  7e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  35.66 
 
 
557 aa  252  9e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  35.04 
 
 
847 aa  252  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  33.4 
 
 
546 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  34.46 
 
 
557 aa  251  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  34.95 
 
 
557 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  35.22 
 
 
1255 aa  251  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  37.2 
 
 
543 aa  248  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  33.12 
 
 
991 aa  248  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  32.55 
 
 
831 aa  246  6e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  34.62 
 
 
692 aa  243  7e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  34.44 
 
 
549 aa  240  4e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  32.75 
 
 
1319 aa  240  5e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  33.25 
 
 
1335 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  34.73 
 
 
559 aa  237  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  37.15 
 
 
512 aa  235  1e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  32.33 
 
 
770 aa  232  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  35.1 
 
 
513 aa  226  6e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  30.83 
 
 
610 aa  220  4e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  33.6 
 
 
515 aa  216  6e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  38.55 
 
 
612 aa  212  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  30.77 
 
 
473 aa  211  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  30.71 
 
 
617 aa  210  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  29.02 
 
 
618 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  32.13 
 
 
620 aa  203  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  33.43 
 
 
622 aa  201  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  34.36 
 
 
474 aa  193  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  32.8 
 
 
472 aa  193  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  34.36 
 
 
472 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  35.98 
 
 
452 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  29.18 
 
 
476 aa  191  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  36.52 
 
 
478 aa  191  3e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  34.08 
 
 
463 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  34.84 
 
 
450 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  34.02 
 
 
515 aa  185  2e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  34.02 
 
 
520 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  34.02 
 
 
521 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  34.02 
 
 
520 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  34.02 
 
 
523 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  34.02 
 
 
523 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  32.88 
 
 
454 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  34.02 
 
 
520 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  31.38 
 
 
458 aa  184  4e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  30.55 
 
 
544 aa  183  5e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  27.54 
 
 
552 aa  181  3e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  27.6 
 
 
552 aa  180  4e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  34.45 
 
 
408 aa  180  5e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  32.54 
 
 
498 aa  180  5e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  26.43 
 
 
553 aa  179  7e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  26.43 
 
 
553 aa  179  7e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  26.43 
 
 
553 aa  179  7e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  26.43 
 
 
553 aa  179  7e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  35.43 
 
 
482 aa  179  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  31.82 
 
 
432 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  35.43 
 
 
485 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  33.44 
 
 
491 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  35.1 
 
 
482 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  27.15 
 
 
548 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  31.38 
 
 
466 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  34.77 
 
 
483 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  31.09 
 
 
467 aa  177  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  39.04 
 
 
442 aa  177  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  33.63 
 
 
462 aa  177  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  33.13 
 
 
491 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  35.1 
 
 
480 aa  176  1e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  35.94 
 
 
453 aa  176  1e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>