82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1337 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1337  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  630  1e-179  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1514  hypothetical protein  30.31 
 
 
334 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000401583 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  37.55 
 
 
257 aa  116  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  23.03 
 
 
278 aa  93.6  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1153  hypothetical protein  48.24 
 
 
95 aa  88.6  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.301811  normal  0.0575588 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  39.44 
 
 
209 aa  85.9  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  46.36 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2025  paREP5  39.73 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  18.58 
 
 
2228 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  35.56 
 
 
143 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  23.49 
 
 
694 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1771  hypothetical protein  21.88 
 
 
307 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1297  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0937853 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0739  hypothetical protein  29.11 
 
 
194 aa  59.3  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000044038 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0140  PKD domain containing protein  12.36 
 
 
1362 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1101  hypothetical protein  20.38 
 
 
229 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.558876 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  19.88 
 
 
526 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0969  KID repeat-containing protein  26.72 
 
 
1702 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1389  hypothetical protein  22.93 
 
 
898 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1286  hypothetical protein  21.97 
 
 
385 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1219  hypothetical protein  21.88 
 
 
567 aa  53.9  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000368049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  22.4 
 
 
178 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1023  hypothetical protein  44.44 
 
 
67 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44913  normal  0.64465 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0549  hypothetical protein  23.53 
 
 
204 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  24.04 
 
 
1235 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  21.81 
 
 
1193 aa  50.1  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0285  hypothetical protein  23.44 
 
 
401 aa  50.1  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.543411  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6447  hypothetical protein  27.57 
 
 
408 aa  49.7  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0461  hypothetical protein  48.65 
 
 
64 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1806  hypothetical protein  24.07 
 
 
595 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0316  hypothetical protein  27.27 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2943  cell wall anchor domain-containing protein  21.2 
 
 
372 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  25.95 
 
 
1232 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  19.82 
 
 
1181 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3021  cell wall anchor domain-containing protein  21.2 
 
 
372 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00330994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3242  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  23.72 
 
 
370 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.48 
 
 
734 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3254  cell wall anchor domain-containing protein  21.2 
 
 
372 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.465207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3006  cell wall anchor domain-containing protein  21.2 
 
 
372 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0946  hypothetical protein  45.24 
 
 
82 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0219  S-layer domain-containing protein  24.03 
 
 
404 aa  47.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0217  S-layer domain-containing protein  24.03 
 
 
404 aa  47.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  21.89 
 
 
1209 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5566  hypothetical protein  22.22 
 
 
410 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.600636 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.56 
 
 
803 aa  46.6  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.470795  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3266  cell wall anchor domain-containing protein  23.08 
 
 
372 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.821191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3009  uncharacterized conserved protein containing internal repeats  26.83 
 
 
132 aa  46.2  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000773583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2005  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  21.2 
 
 
367 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122314  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2700  hypothetical protein  19.63 
 
 
145 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  20.3 
 
 
1016 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2601  hypothetical protein  27.27 
 
 
708 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2970  cell wall anchor domain-containing protein  23.72 
 
 
374 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.42 
 
 
1170 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  19.75 
 
 
1082 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  13.64 
 
 
1621 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0272  S-layer domain-containing protein  15.48 
 
 
434 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  23.56 
 
 
1170 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2690  peptidase  26.9 
 
 
607 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.466836  normal  0.22304 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33608  predicted protein  31.01 
 
 
656 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.145963  normal  0.0588293 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  21.05 
 
 
786 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0673  phage minor structural protein  16.9 
 
 
1585 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  28.85 
 
 
702 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  21.19 
 
 
403 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  25.52 
 
 
1188 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1374  hypothetical protein  22.54 
 
 
406 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.643705 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  21.19 
 
 
403 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04670  conserved hypothetical protein  20.96 
 
 
2094 aa  43.9  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  22.58 
 
 
1164 aa  43.9  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3272  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  22.64 
 
 
372 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  21.43 
 
 
1046 aa  43.5  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  20.5 
 
 
361 aa  43.5  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00600  endocytosis-related protein, putative  22.16 
 
 
1601 aa  43.5  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0788  chemotaxis sensory transducer  31.91 
 
 
529 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1104  chromosome segregation ATPase-like protein  16.48 
 
 
1359 aa  43.1  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  24.17 
 
 
1169 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1846  hypothetical protein  23.77 
 
 
278 aa  43.1  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0063  hypothetical protein  34.18 
 
 
179 aa  43.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.261696  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  24.17 
 
 
1169 aa  43.1  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  23.43 
 
 
858 aa  42.7  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1496  chromosome segregation ATPase-like protein  28.89 
 
 
985 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0412126  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  19.47 
 
 
1191 aa  42.7  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1101  hypothetical protein  32.04 
 
 
157 aa  42.4  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>