139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1326 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1326  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  734    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0841  hypothetical protein  70.41 
 
 
394 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0308  hypothetical protein  59.62 
 
 
386 aa  290  2e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0830  hypothetical protein  36.91 
 
 
410 aa  145  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  28.13 
 
 
429 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  29.72 
 
 
423 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1501  hypothetical protein  31.49 
 
 
452 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  29.1 
 
 
451 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  30.32 
 
 
443 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1590  protein of unknown function DUF107  30.1 
 
 
471 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2369  nodulation efficiency protein NfeD  31.39 
 
 
472 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  29.34 
 
 
437 aa  99.8  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1495  protein of unknown function DUF107  30.1 
 
 
471 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  29.95 
 
 
433 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  30.22 
 
 
430 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0813  nodulation efficiency protein NfeD  31.25 
 
 
446 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000363847  hitchhiker  0.000000223757 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  30.39 
 
 
437 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  31.63 
 
 
421 aa  96.7  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  29.66 
 
 
460 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  31.63 
 
 
425 aa  94  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  30.94 
 
 
439 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1477  hypothetical protein  27.7 
 
 
436 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1515  hypothetical protein  29.77 
 
 
486 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.331785  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  26.83 
 
 
436 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  27.91 
 
 
438 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  26.87 
 
 
458 aa  90.1  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  27.92 
 
 
442 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  25.96 
 
 
454 aa  87  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  27.95 
 
 
444 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000176034  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  28.22 
 
 
453 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1959  membrane-bound serine protease (ClpP class), putative  27.41 
 
 
470 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  27 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  27.74 
 
 
452 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  27.55 
 
 
464 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1056  hypothetical protein  26 
 
 
438 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.919893 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  26.9 
 
 
463 aa  78.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1818  hypothetical protein  30.22 
 
 
424 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163142  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1169  protein of unknown function DUF107  27.56 
 
 
434 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0123968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  27 
 
 
472 aa  76.6  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  28.99 
 
 
447 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  25.53 
 
 
472 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  25.05 
 
 
456 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0766  protein of unknown function DUF107  23.41 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  29.13 
 
 
467 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0014  hypothetical protein  36.77 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  25.61 
 
 
496 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  27.55 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  26.68 
 
 
446 aa  73.9  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2658  hypothetical protein  26.18 
 
 
501 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.853599  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  25.9 
 
 
462 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  26.12 
 
 
491 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  24.6 
 
 
488 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  26.59 
 
 
464 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  25 
 
 
462 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2887  hypothetical protein  26.68 
 
 
501 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0527  non-proteolytic membrane spanning protein, peptidase family S49  26.89 
 
 
458 aa  69.7  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3029  hypothetical protein  26.96 
 
 
501 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0916  NfeD family protein  27.96 
 
 
503 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  26.83 
 
 
481 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1572  hypothetical protein  24.63 
 
 
498 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0803  hypothetical protein  26.85 
 
 
470 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2176  nodulation efficiency protein D  27.96 
 
 
560 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1160  nodulation efficiency protein NfeD  26.51 
 
 
445 aa  66.2  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00735841  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1661  nfeD family protein  25.7 
 
 
458 aa  66.2  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.125508  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  25.22 
 
 
458 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  31.19 
 
 
473 aa  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0391  protein of unknown function DUF107  30.65 
 
 
452 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  23.86 
 
 
455 aa  64.7  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  27.06 
 
 
488 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  25.17 
 
 
455 aa  64.3  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0824  NfeD family protein  27.95 
 
 
501 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  27.39 
 
 
557 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  26.4 
 
 
489 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  26.38 
 
 
453 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2190  hypothetical protein  27.25 
 
 
468 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2167  nodulation efficiency protein NfeD  36.05 
 
 
428 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  26.93 
 
 
448 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  24.31 
 
 
828 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  25.28 
 
 
524 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0037  nodulation efficiency protein NfeD  32.5 
 
 
452 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280773  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1786  hypothetical protein  25.65 
 
 
500 aa  59.7  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1023  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  25.31 
 
 
529 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2149  hypothetical protein  26.02 
 
 
488 aa  58.9  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  25.38 
 
 
407 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1336  hypothetical protein  27.65 
 
 
464 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.965224  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  26.04 
 
 
465 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  25.46 
 
 
424 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1623  hypothetical protein  26.8 
 
 
464 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.475533 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  27.19 
 
 
510 aa  56.2  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1013  protein of unknown function DUF107  24.82 
 
 
455 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3380  protein of unknown function DUF107  26.1 
 
 
467 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  22.55 
 
 
447 aa  53.1  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0712  membrane-bound serine protease  38.38 
 
 
525 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05880  putative membrane-bound protease  28.98 
 
 
443 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0068  hypothetical protein  24.49 
 
 
454 aa  52.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1783  hypothetical protein  29.76 
 
 
490 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  28.76 
 
 
449 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5321  hypothetical protein  24.55 
 
 
516 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00956153  decreased coverage  0.00774804 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  32.98 
 
 
279 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5652  protein of unknown function DUF107  35.45 
 
 
522 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.995494 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>