130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1310 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  308  2e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  47.52 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  44.23 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  37.6 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  43.86 
 
 		 177 aa  98.2  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  40.87 
 
 		 189 aa  96.3  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  35.65 
 
 		 576 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  39.13 
 
 		 182 aa  88.2  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  42.45 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  33.93 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  40.57 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  47.06 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  43.53 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  34.55 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  31.82 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  34.86 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  33.03 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  52.83 
 
 		 335 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  32.41 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  32.41 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  28.12 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  40.48 
 
 		 320 aa  61.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  27.05 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  31.73 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  30.77 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  28.45 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  31.3 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  34.74 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  29.75 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  31.73 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  28.97 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  31.78 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  31.46 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  32.18 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  35.64 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  28.18 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  34.34 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  27.42 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  30.28 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  30.1 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  29.31 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  36.36 
 
 		 319 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  30.48 
 
 		 315 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  28.28 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  25.86 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  29 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  34.62 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  28.74 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  29.81 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  28.46 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  27.05 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  26.98 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  25 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  25.6 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  31.65 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  27.1 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  27.68 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  28.28 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  36.49 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  28.74 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  27.97 
 
 		 319 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  31.31 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  32.32 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  26.17 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  27.78 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  30.61 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  34.18 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  33.01 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  30.95 
 
 		 413 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  26.98 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  29.9 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  25.83 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  38.57 
 
 		 338 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  29.25 
 
 		 334 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  27.59 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  25.86 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  38.57 
 
 		 338 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  38.57 
 
 		 338 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0598  protein of unknown function DUF35  30.48 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2784  protein of unknown function DUF35  27.85 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211194  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  29.03 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3780  protein of unknown function DUF35  28.69 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000111928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  23.73 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  29.59 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  25.89 
 
 		 311 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  27.45 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  28.85 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2808  protein of unknown function DUF35  27.12 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0884467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  25 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  20 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  30.77 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3885  hypothetical protein  26.27 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  27.59 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>