20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1232 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 145 aa  292  1e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.304231 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0478  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  69.44 
 
 		 145 aa  201  3e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.49685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1350  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  68.97 
 
 		 146 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0323  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  66.67 
 
 		 143 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.108056  normal  0.0606842 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.7 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.548712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.59 
 
 		 216 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.17 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.83 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30 
 
 		 212 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.97 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.69 
 
 		 254 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1798  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.8 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000155018  normal  0.388936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.83 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.68 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.34 
 
 		 254 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.79 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  38.6 
 
 		 262 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  37.04 
 
 		 997 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4318  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.35 
 
 		 225 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.531167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>