More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1166 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1166  SPP-like hydrolase  100 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1965  SPP-like hydrolase  81.53 
 
 		 230 aa  378  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0481119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0788  SPP-like hydrolase  80.09 
 
 		 228 aa  380  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00672208 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0866  SPP-like hydrolase  85.09 
 
 		 228 aa  365  1e-100  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1223  SPP-like hydrolase  40.43 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0131794  normal  0.788944 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2130  SPP-like hydrolase  37.8 
 
 		 222 aa  115  7.999999999999999e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000000113582  hitchhiker  0.0000579549 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1070  SPP-like hydrolase  32.89 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0195406  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0884  SPP-like hydrolase  33.33 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2100  SPP-like hydrolase  33.93 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2034  phosphoglycolate phosphatase  30.87 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.376803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  33.19 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  30.84 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1633  SPP-like hydrolase  32.37 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.64059  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2337  phosphoglycolate phosphatase  30.47 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  0.0135027 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1119  SPP-like hydrolase  35.89 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.660919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  28.14 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0041  SPP-like hydrolase  34.05 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  39.36 
 
 		 270 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1809  SPP-like hydrolase  35.27 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.752467  normal  0.527936 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  24.54 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0436  putative HAD superfamily hydrolase  26.02 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.237165  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  39.33 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  24.28 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  40.45 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3464  Cof-like hydrolase  38.89 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  24.18 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  26.2 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2968  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.4 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0685  SPP-like hydrolase  25 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  36.9 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3772  Cof-like hydrolase  37.78 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  25.84 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  25.84 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  25.84 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0566  HAD family hydrolase  25.73 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0688357 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  25.84 
 
 		 270 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  38.55 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  24.06 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  23.97 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  25.36 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  25.36 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  25.36 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  25.36 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  25.36 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  25.36 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  25.36 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  38.2 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  35.92 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  33.19 
 
 		 554 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  33.19 
 
 		 554 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  23.81 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3874  HAD family hydrolase  26.23 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0597322 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  25.56 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  25.36 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  25.47 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1562  Cof-like hydrolase  43.42 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104668  normal  0.0533762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  25.83 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  24.71 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  32.24 
 
 		 550 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  24.18 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0938  SPP-like hydrolase  31.22 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  40.26 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0257  hydrolase  37.93 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.509124  hitchhiker  0.000575913 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1156  SPP-like hydrolase  33.05 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  27.63 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1945  HAD family hydrolase  28.51 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  41.49 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  25.54 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1097  HAD superfamily hydrolase  22.68 
 
 		 273 aa  57  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000207763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  28.4 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  27.63 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6359  Cof-like hydrolase  41.57 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164075 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.96 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  33.96 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  31.68 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  30.93 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  24.56 
 
 		 722 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  25.56 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  31.36 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  21.59 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  24.81 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  33.96 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2884  SPP-like hydrolase  30.49 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.96 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  33.96 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  33.96 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  33.96 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  33.96 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.02 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  26.18 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  27.24 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  30.69 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  25.63 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  39.33 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0205  HAD superfamily hydrolase  30.17 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.855458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  35.92 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.02 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  23.9 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  24.81 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>