More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1143 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  100 
 
 		 138 aa  274  3e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  76.64 
 
 		 139 aa  223  9e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  72.99 
 
 		 139 aa  217  3e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  70.07 
 
 		 139 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  46.96 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  40.32 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  42.61 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  42.4 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  44.07 
 
 		 614 aa  87.4  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  43.24 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  42.86 
 
 		 136 aa  84.3  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  43.75 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  44.04 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 		 625 aa  80.9  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  39.32 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  42.02 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  39.5 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  36.89 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  39.83 
 
 		 615 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  35.43 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  38.14 
 
 		 615 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  37.61 
 
 		 624 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  34.75 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  39.32 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  37.1 
 
 		 688 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  36.29 
 
 		 688 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36.75 
 
 		 605 aa  74.7  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  42.74 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  39.2 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  34.75 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  30.71 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  38.98 
 
 		 625 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  40.68 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 		 688 aa  74.3  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  39.34 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  38.66 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  39.5 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  38.98 
 
 		 618 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  37.72 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  36.61 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  35.11 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  39.84 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  34.35 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  34.75 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  39.32 
 
 		 606 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  37.29 
 
 		 615 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  39.32 
 
 		 606 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  38.52 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  38.66 
 
 		 641 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  37.29 
 
 		 615 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  34.78 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  38.83 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  41.96 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  38.33 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  41.28 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  38.89 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  35.77 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  33.88 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 		 620 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  34.75 
 
 		 615 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  36.21 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 		 606 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  35.54 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0173  signal-transduction protein  41.27 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  33.88 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  38.14 
 
 		 615 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  37.61 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  38.14 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 623 aa  67.8  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  36.11 
 
 		 646 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  33.93 
 
 		 638 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  32.73 
 
 		 689 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  36.67 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  35.2 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  32.37 
 
 		 626 aa  67.4  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  36.67 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  36.61 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  44.79 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  33.9 
 
 		 615 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  39.09 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.96 
 
 		 648 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4227  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.34 
 
 		 520 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  33.06 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2491  signal-transduction protein  38.21 
 
 		 574 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 		 615 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2632  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.2 
 
 		 486 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  33.9 
 
 		 615 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  39.09 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  36.07 
 
 		 663 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  35.83 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.9 
 
 		 615 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.39 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  30.51 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>