113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1083 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  269  9e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  81.06 
 
 		 132 aa  232  1.0000000000000001e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  82.44 
 
 		 133 aa  227  4e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  81.82 
 
 		 134 aa  226  6e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  60.47 
 
 		 137 aa  160  6e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  46.83 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  46.83 
 
 		 130 aa  114  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  45.24 
 
 		 130 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  42.75 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  45.67 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  44.35 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  39.23 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  43.51 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  39.23 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  37.8 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  40.16 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  43.31 
 
 		 135 aa  97.1  8e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  39.2 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  34.11 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  35.94 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  38.3 
 
 		 474 aa  84  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  33.59 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  36.29 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  34.48 
 
 		 490 aa  75.5  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  30.23 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  36.69 
 
 		 481 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  33.81 
 
 		 473 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  40.57 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  37.37 
 
 		 576 aa  70.9  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  36.84 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0984  hypothetical protein  35.2 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  38.54 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  32.52 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  33.91 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3871  hypothetical protein  31.5 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1145  protein of unknown function DUF35  30.77 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0574924  hitchhiker  0.0000746026 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  30.95 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  31.15 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  33.64 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  36.84 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 		 913 aa  57.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  32.14 
 
 		 474 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  29.84 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  29.84 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  35.11 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  27.45 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  31.86 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  26.79 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  31.15 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  28.91 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  36.62 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  34.78 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  32.69 
 
 		 417 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  32.03 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  29.51 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  31.03 
 
 		 474 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  30.39 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  26.17 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  30.28 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  32.65 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  34.74 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  32.56 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  27.78 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  29.36 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  30.28 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  29.79 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  31.18 
 
 		 315 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  31.13 
 
 		 417 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  29.36 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  30.43 
 
 		 305 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  30.11 
 
 		 319 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  25.42 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  32.61 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  30.7 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  28.68 
 
 		 495 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  27.18 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  27.27 
 
 		 319 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5351  protein of unknown function DUF35  27.97 
 
 		 490 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  29.47 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  25.24 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  26.27 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  32.63 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  28.8 
 
 		 321 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  29.9 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  30.83 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  29.25 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  31.37 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  32.63 
 
 		 548 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  30.08 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  32.41 
 
 		 334 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  31.58 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  26.21 
 
 		 138 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  30.93 
 
 		 550 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  30.3 
 
 		 319 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  27.73 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  26.21 
 
 		 138 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  30.93 
 
 		 550 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>