152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1049 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  51.69 
 
 		 794 aa  793    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  78.93 
 
 		 785 aa  1285    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  79.16 
 
 		 784 aa  1237    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  100 
 
 		 783 aa  1552    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  79.18 
 
 		 786 aa  1262    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  48.41 
 
 		 783 aa  719    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  52.47 
 
 		 781 aa  792    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1060  DNA-directed DNA polymerase  30.93 
 
 		 764 aa  402  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.474491  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  29.41 
 
 		 781 aa  346  1e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  29.11 
 
 		 780 aa  345  2e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  29.95 
 
 		 780 aa  343  5e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  28.76 
 
 		 810 aa  332  1e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  27.64 
 
 		 811 aa  326  1e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  29.52 
 
 		 941 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  29.85 
 
 		 910 aa  281  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  29.36 
 
 		 932 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  31.02 
 
 		 812 aa  260  7e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  27.48 
 
 		 796 aa  243  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  28.91 
 
 		 795 aa  242  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  28.79 
 
 		 784 aa  239  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  29.18 
 
 		 912 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  29.24 
 
 		 1070 aa  233  8.000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  28.83 
 
 		 1058 aa  231  3e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  30.76 
 
 		 607 aa  229  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  28.41 
 
 		 982 aa  227  7e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  26.46 
 
 		 818 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  27.95 
 
 		 821 aa  219  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  28.76 
 
 		 1044 aa  215  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  28.53 
 
 		 853 aa  210  8e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  28.68 
 
 		 791 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  28.41 
 
 		 853 aa  208  4e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  28.07 
 
 		 854 aa  206  9e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  26.49 
 
 		 929 aa  207  9e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  28.43 
 
 		 816 aa  204  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  28.15 
 
 		 882 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  26.85 
 
 		 854 aa  202  3e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  27.64 
 
 		 786 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  29.13 
 
 		 787 aa  200  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  28.21 
 
 		 786 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  29.97 
 
 		 792 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  28.18 
 
 		 788 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  28.75 
 
 		 789 aa  195  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  27.6 
 
 		 877 aa  194  4e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  28.01 
 
 		 789 aa  194  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  29.26 
 
 		 787 aa  194  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  27.04 
 
 		 786 aa  193  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  25.85 
 
 		 1087 aa  192  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  28.61 
 
 		 787 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  27.68 
 
 		 786 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  27.68 
 
 		 786 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  28.77 
 
 		 793 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  27.29 
 
 		 783 aa  189  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  29.85 
 
 		 788 aa  188  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  27.15 
 
 		 783 aa  187  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  27.33 
 
 		 794 aa  187  9e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  27.01 
 
 		 783 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  27.41 
 
 		 787 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  26.82 
 
 		 835 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  24.75 
 
 		 852 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  26.8 
 
 		 783 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  26.8 
 
 		 783 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  26.8 
 
 		 783 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  26.8 
 
 		 783 aa  184  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  26.8 
 
 		 783 aa  184  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  26.68 
 
 		 783 aa  184  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  26.86 
 
 		 816 aa  184  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  28.69 
 
 		 788 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  29.58 
 
 		 787 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  26.67 
 
 		 783 aa  183  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  27.56 
 
 		 793 aa  183  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  27.92 
 
 		 794 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  27.35 
 
 		 786 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  26.88 
 
 		 783 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  26.8 
 
 		 783 aa  181  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  25.59 
 
 		 810 aa  180  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  26.06 
 
 		 787 aa  180  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  26.53 
 
 		 783 aa  180  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  25.83 
 
 		 1485 aa  180  8e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  27.38 
 
 		 787 aa  180  9e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  27.92 
 
 		 794 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  27.92 
 
 		 794 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  26.16 
 
 		 810 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  26.68 
 
 		 795 aa  179  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  26.95 
 
 		 871 aa  179  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  24.78 
 
 		 808 aa  177  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  28.41 
 
 		 788 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  25.44 
 
 		 810 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  28.33 
 
 		 791 aa  174  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  25.86 
 
 		 820 aa  174  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  28.42 
 
 		 790 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  27.29 
 
 		 788 aa  172  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  24.76 
 
 		 782 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  25.24 
 
 		 818 aa  171  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0609  DNA polymerase II  28.07 
 
 		 790 aa  171  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  27.44 
 
 		 790 aa  170  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  27.52 
 
 		 1463 aa  168  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  26.99 
 
 		 789 aa  167  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  27.11 
 
 		 788 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  26.99 
 
 		 789 aa  167  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  26.99 
 
 		 789 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>