41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1033 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1033  50S ribosomal protein L15P  100 
 
 		 156 aa  308  2e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000237076 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0963  50S ribosomal protein L15P  78.21 
 
 		 156 aa  260  6e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1873  50S ribosomal protein L15P  82.69 
 
 		 155 aa  244  3e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1303  50S ribosomal protein L15P  81.41 
 
 		 156 aa  241  3e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0234  50S ribosomal protein L15P  50 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0113  50S ribosomal protein L15P  46.62 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000229417  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1756  ribosomal protein L15  44 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100866  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1406  50S ribosomal protein L15P  39.86 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0157  50S ribosomal protein L15P  38.78 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0666  50S ribosomal protein L15P  38.78 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.884214  normal  0.0159889 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1252  50S ribosomal protein L15P  38.1 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0732  50S ribosomal protein L15P  38.1 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0704  ribosomal protein L15  45.7 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.54359  hitchhiker  0.00000000344953 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0436  hypothetical protein  89.58 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0401  50S ribosomal protein L15  37.04 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.102772 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10416  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L27a (Broad)  36.24 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02420  structural constituent of ribosome, putative  36.13 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322968  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1499  ribosomal protein L15  37.67 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00385105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0088  50S ribosomal protein L15P  40 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0238604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43162  predicted protein  32.17 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77282  large subunit ribosomal protein L27Ae (RPL28)  33.56 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  34.97 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27402  Ribosomal protein L27aA, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  30.56 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27472  Ribosomal protein L27aB, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  30.56 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2231  50S ribosomal protein L15P  26.74 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.335926  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0103  50S ribosomal protein L15P  31.82 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.859381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0464  50S ribosomal protein L15P  30.77 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  31.25 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2240  ribosomal protein L15  32.64 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2427  50S ribosomal protein L15P  34.25 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  31.16 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2314  50S ribosomal protein L15P  30.87 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0972906  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0232  ribosomal protein L15  32.64 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2277  50S ribosomal protein L15  26.98 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000152884  hitchhiker  0.00354072 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1850  50S ribosomal protein L15P  33.11 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.701641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  33.33 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  38.04 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  32.41 
 
 		 141 aa  41.2  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  36.17 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>