64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0995 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  100 
 
 
266 aa  527  1e-149  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  83.02 
 
 
265 aa  459  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  83.33 
 
 
264 aa  455  1e-127  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  81.44 
 
 
264 aa  449  1e-125  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  42.05 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  38.67 
 
 
266 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.6 
 
 
265 aa  152  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.24 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.58 
 
 
265 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.25 
 
 
256 aa  132  6e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.06 
 
 
265 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.64 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.51 
 
 
261 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.71 
 
 
265 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.92 
 
 
264 aa  123  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  32.2 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.28 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.87 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.9 
 
 
268 aa  113  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.67 
 
 
257 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.03 
 
 
263 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  27.35 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.7 
 
 
277 aa  95.9  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  26.97 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.51 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.46 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  26.09 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.64 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  27 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  26.2 
 
 
308 aa  62.8  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  26.67 
 
 
320 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  35.9 
 
 
559 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  30.67 
 
 
121 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  24.27 
 
 
322 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  31.71 
 
 
559 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  31.71 
 
 
559 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0500  30S ribosomal protein S1  32.43 
 
 
557 aa  46.2  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.71 
 
 
707 aa  46.2  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1308  30S ribosomal protein S1  32.43 
 
 
557 aa  46.2  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.302956  hitchhiker  0.0000000365743 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0956  30S ribosomal protein S1  31.71 
 
 
573 aa  45.8  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000014577  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  30.43 
 
 
563 aa  45.4  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1750  ribosomal protein S1  37.8 
 
 
563 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00710774  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0972  30S ribosomal protein S1  36.59 
 
 
556 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.577662  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0902  30S ribosomal protein S1  36.59 
 
 
556 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3642  30S ribosomal protein S1  37.8 
 
 
563 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0546866  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0920  30S ribosomal protein S1  36.59 
 
 
556 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  32.5 
 
 
562 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4072  30S ribosomal protein S1  34.12 
 
 
561 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000537264  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  27.83 
 
 
560 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  36.99 
 
 
558 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1190  30S ribosomal protein S1  37.8 
 
 
517 aa  43.5  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  36.99 
 
 
558 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  36.99 
 
 
558 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  36.99 
 
 
558 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0613  RNA binding S1 domain protein  37.8 
 
 
558 aa  43.1  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000620529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  30.95 
 
 
124 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  35.62 
 
 
571 aa  42.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  32.88 
 
 
589 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  34.25 
 
 
570 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  31.65 
 
 
811 aa  42  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  34.25 
 
 
576 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  34.25 
 
 
576 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  34.25 
 
 
570 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0873  30S ribosomal protein S1  34.62 
 
 
551 aa  42  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0435842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>