21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0955 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1404  hypothetical protein  75.06 
 
 
425 aa  660    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0849  hypothetical protein  73.52 
 
 
431 aa  669    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0769566 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1914  hypothetical protein  73.76 
 
 
429 aa  680    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0955  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  856    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0041  hypothetical protein  40.14 
 
 
439 aa  315  7e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.395847  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0195  GTPase or GTP-binding protein  26.17 
 
 
421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1123  hypothetical protein  28.22 
 
 
353 aa  89  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000483449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0084  hypothetical protein  24.16 
 
 
353 aa  88.2  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0989  GTPase or GTP-binding protein-like protein  24.61 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1840  conserved hypothetical protein  27.7 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.545103  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0047  hypothetical protein  27.41 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3491  GTPase or GTP-binding protein-like protein  31.55 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0075  hypothetical protein  23.06 
 
 
355 aa  72.8  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.109256 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0398  AAA ATPase  28.75 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1427  AAA ATPase  27.39 
 
 
290 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2475  GTPase or GTP-binding protein-like protein  27.15 
 
 
310 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30338  predicted protein  26.98 
 
 
429 aa  53.5  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48855  predicted protein  29.11 
 
 
903 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105124  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2988  GTPase or GTP-binding protein-like protein  27.81 
 
 
276 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2037  GTPase or GTP-binding protein-like protein  27.08 
 
 
328 aa  51.2  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.677011  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33311  predicted protein  26.76 
 
 
663 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.567773  normal  0.0126253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>