200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0917 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  72.12 
 
 
687 aa  1044    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  100 
 
 
683 aa  1387    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  76.28 
 
 
685 aa  1068    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  40.89 
 
 
700 aa  464  1e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  44.87 
 
 
661 aa  453  1.0000000000000001e-126  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  40.97 
 
 
656 aa  445  1e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  40.1 
 
 
743 aa  436  1e-121  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  40.34 
 
 
779 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  34.51 
 
 
801 aa  344  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  33.39 
 
 
776 aa  337  5.999999999999999e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  37.48 
 
 
762 aa  330  7e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  34.23 
 
 
821 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  33.44 
 
 
779 aa  326  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  35.24 
 
 
816 aa  320  6e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  34.39 
 
 
752 aa  319  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  35.9 
 
 
803 aa  318  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  33.69 
 
 
828 aa  314  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  33.1 
 
 
794 aa  313  5.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  35.15 
 
 
779 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  30.72 
 
 
777 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  32.97 
 
 
799 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  31.45 
 
 
792 aa  304  4.0000000000000003e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  32.95 
 
 
785 aa  303  9e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  31.38 
 
 
797 aa  299  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  33.1 
 
 
798 aa  293  6e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  32.05 
 
 
768 aa  291  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  32.11 
 
 
806 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  27.98 
 
 
746 aa  281  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  30.05 
 
 
728 aa  268  2.9999999999999995e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  33.33 
 
 
815 aa  266  8e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  29.58 
 
 
702 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  32.34 
 
 
825 aa  266  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  33.96 
 
 
828 aa  263  4.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2648  glycosy hydrolase family protein  27.8 
 
 
715 aa  263  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2334  alpha-glucosidase  27.49 
 
 
715 aa  258  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  30.74 
 
 
715 aa  256  7e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11054  alpha glucosidase II, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03500)  32.14 
 
 
952 aa  252  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.464256  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  33.58 
 
 
911 aa  252  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05150  alpha glucosidase, putative  32.14 
 
 
956 aa  249  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133027  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  30.58 
 
 
845 aa  248  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  29.6 
 
 
692 aa  247  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  28.89 
 
 
836 aa  238  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  31.09 
 
 
791 aa  233  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  30.17 
 
 
788 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  29.65 
 
 
770 aa  223  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  32.25 
 
 
803 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  28.82 
 
 
795 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  28.82 
 
 
795 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  31.82 
 
 
803 aa  221  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  31.26 
 
 
806 aa  220  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.67 
 
 
787 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  31.78 
 
 
813 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  31.77 
 
 
803 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  29.48 
 
 
791 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  31.15 
 
 
806 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  31.28 
 
 
806 aa  218  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  29.48 
 
 
791 aa  218  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  31.2 
 
 
806 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  31.2 
 
 
806 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  31.2 
 
 
806 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  29.48 
 
 
789 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  29.34 
 
 
799 aa  214  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  29.55 
 
 
790 aa  214  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  30.54 
 
 
760 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.44 
 
 
788 aa  211  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.32 
 
 
788 aa  206  8e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  30.9 
 
 
821 aa  206  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  27.85 
 
 
765 aa  206  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50836  alpha subunit of glucosidase  28.75 
 
 
712 aa  198  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.312978  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  27.43 
 
 
839 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  28.73 
 
 
765 aa  197  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  27.9 
 
 
821 aa  195  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  28.35 
 
 
784 aa  193  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  26.78 
 
 
772 aa  186  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  27.74 
 
 
760 aa  185  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  26.27 
 
 
783 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  26.63 
 
 
764 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  26.19 
 
 
764 aa  180  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  27.3 
 
 
771 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  26.45 
 
 
836 aa  179  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  25.91 
 
 
806 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  27.45 
 
 
779 aa  179  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.69 
 
 
973 aa  177  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  26.78 
 
 
772 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  30.04 
 
 
778 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  26.78 
 
 
772 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  31.45 
 
 
944 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  27.54 
 
 
840 aa  175  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  26.69 
 
 
772 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  26.61 
 
 
772 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  26.53 
 
 
661 aa  172  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  27.31 
 
 
794 aa  171  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  26.61 
 
 
772 aa  170  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  27.11 
 
 
679 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  26.47 
 
 
752 aa  169  1e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  27.11 
 
 
679 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  27.89 
 
 
795 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  26.03 
 
 
668 aa  169  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  26.93 
 
 
679 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  26.28 
 
 
774 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>