106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0729 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0729  manganese containing catalase  100 
 
 
298 aa  611  1e-174  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  1.23231e-11 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1142  manganese containing catalase  89.26 
 
 
298 aa  553  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0584316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1316  Catalase  64.63 
 
 
294 aa  392  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2783  manganese containing catalase  64.97 
 
 
296 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00681002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3115  manganese containing catalase  61.56 
 
 
299 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0952  Catalase  61.2 
 
 
302 aa  365  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684232  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0681  manganese containing catalase  61.36 
 
 
297 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400648  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4224  manganese containing catalase  47.37 
 
 
307 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0292992  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5292  manganese containing catalase  49.5 
 
 
304 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0651334  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4741  manganese containing catalase  47.37 
 
 
307 aa  276  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4594  manganese containing catalase  47.04 
 
 
307 aa  276  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.756991  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5945  manganese containing catalase  47.84 
 
 
304 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995052  normal  0.0254671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5727  manganese containing catalase  47.51 
 
 
304 aa  270  3e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.388852  hitchhiker  0.00719162 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11980  Mn-containing catalase  44.22 
 
 
321 aa  229  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2882  Mn-containing catalase  39.36 
 
 
308 aa  205  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3134  catalase, Mn-containing  39.36 
 
 
284 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3134  catalase, Mn-containing  39.36 
 
 
284 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2914  catalase, Mn-containing  39.36 
 
 
287 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2123  catalase, Mn-containing  39.35 
 
 
284 aa  201  1e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2839  manganese containing catalase  39.35 
 
 
287 aa  200  2e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3157  Mn-containing catalase  38.04 
 
 
249 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117641  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2836  Catalase  34.25 
 
 
284 aa  134  2e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0774925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1848  Catalase  37.25 
 
 
301 aa  129  9e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  0.135263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0886  catalase  35.78 
 
 
302 aa  128  1e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1876  manganese containing catalase  34.6 
 
 
292 aa  127  2e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20670  Mn-containing catalase  31.64 
 
 
289 aa  122  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0221  Catalase  33.78 
 
 
286 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1600  Catalase  32.93 
 
 
316 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1447  manganese containing catalase  33.5 
 
 
270 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0815  Catalase  35.23 
 
 
308 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.683068  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5296  Catalase  25.61 
 
 
287 aa  110  4e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.201236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1680  Catalase  27.31 
 
 
290 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1877  Catalase  31.66 
 
 
303 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0517  Catalase  26.57 
 
 
290 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6390  catalase  30.28 
 
 
274 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3979  catalase  33.01 
 
 
274 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819277  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0606  catalase  32.17 
 
 
297 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5807  Catalase  28.62 
 
 
275 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12571  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2898  Catalase  31.49 
 
 
285 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.808431  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3002  Catalase  30.73 
 
 
285 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0705397  normal  0.0852902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2775  catalase  30.73 
 
 
285 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  30.63 
 
 
421 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1821  catalase  26.77 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  0.0328704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2075  catalase  30.64 
 
 
285 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1864  Catalase  31.91 
 
 
224 aa  86.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.299932  normal  0.0213876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2921  Catalase  29.9 
 
 
324 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1329  Catalase  30.5 
 
 
276 aa  84.3  2e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.714734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1016  catalase  28.87 
 
 
228 aa  83.6  4e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00169796  unclonable  3.43768e-09 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6253  catalase  31.53 
 
 
304 aa  82.4  7e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1578  catalase  31.53 
 
 
304 aa  82.4  7e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6729  catalase  31.53 
 
 
301 aa  82.4  8e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3293  Catalase  29.08 
 
 
326 aa  81.3  2e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1780  Catalase  30.65 
 
 
205 aa  81.3  2e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2788  manganese containing catalase  29.21 
 
 
291 aa  79  8e-14  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5520  catalase  30.54 
 
 
308 aa  79.3  8e-14  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1673  catalase  26.03 
 
 
277 aa  79  9e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.849273  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4798  catalase  28.57 
 
 
300 aa  77.8  2e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5037  Catalase  26.76 
 
 
310 aa  77.4  3e-13  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1104  Catalase  28.18 
 
 
231 aa  77.4  3e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  4.26374e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03960  Catalase  29.51 
 
 
227 aa  77  4e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00363943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1645  catalase  26.73 
 
 
296 aa  76.6  5e-13  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5251  catalase  30.2 
 
 
301 aa  76.6  5e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5095  catalase  28.85 
 
 
293 aa  75.1  1e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3129  catalase  28.22 
 
 
290 aa  75.5  1e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1597  catalase  27.64 
 
 
292 aa  74.3  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.577365 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3122  Mn-containing catalase  29.56 
 
 
298 aa  74.3  2e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2165  Catalase  28.06 
 
 
189 aa  74.7  2e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0288  manganese containing catalase  29.05 
 
 
245 aa  74.7  2e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1863  catalase  27.64 
 
 
292 aa  74.3  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.958813 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1348  DNA mismatch endonuclease  29.56 
 
 
298 aa  74.3  2e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3821  manganese containing catalase  29.44 
 
 
230 aa  74.3  2e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00457633  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1921  catalase  27.64 
 
 
292 aa  74.3  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0512858  hitchhiker  0.000184673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0376  manganese containing catalase  29.41 
 
 
249 aa  73.6  3e-12  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2997  Mn-containing catalase  29.56 
 
 
314 aa  73.6  3e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1858  catalase  27.64 
 
 
292 aa  73.6  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.724494 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1415  catalase  27.64 
 
 
292 aa  73.2  6e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.449813  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0318  non-heme catalase KatN  29.7 
 
 
294 aa  72.8  7e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2781  manganese containing catalase  29.61 
 
 
260 aa  72.8  7e-12  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4409  catalase  27.64 
 
 
303 aa  71.6  1e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47080  Mn-containing catalase  29.21 
 
 
291 aa  71.6  1e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3384  catalase  27.27 
 
 
231 aa  72  1e-11  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000494245  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1620  manganese containing catalase  28.33 
 
 
230 aa  71.2  2e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266489 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1436  catalase  28.22 
 
 
293 aa  69.7  5e-11  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2044  Catalase  28.22 
 
 
290 aa  69.3  8e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  1.98818e-07 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0414  manganese containing catalase  27.53 
 
 
203 aa  64.3  3e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23050  manganese containing catalase  27.13 
 
 
193 aa  63.5  4e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.16085e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1068  spore coat protein CotJC  27.61 
 
 
188 aa  63.5  4e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00620626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0934  spore coat peptide assembly protein CotJC  25.15 
 
 
188 aa  63.2  5e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0072871  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1213  manganese containing catalase  26.88 
 
 
190 aa  63.2  5e-09  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.645424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0440  Catalase  26.97 
 
 
189 aa  60.1  4e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2909  manganese containing catalase  26.14 
 
 
190 aa  59.7  7e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0232  Catalase  26.8 
 
 
200 aa  59.3  7e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2189  manganese containing catalase  26.4 
 
 
189 aa  57.4  3e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1392  manganese containing catalase  25.57 
 
 
190 aa  55.5  1e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0716  manganese containing catalase  24.72 
 
 
189 aa  54.7  2e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.21736e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0766  cotJC protein  25.41 
 
 
189 aa  51.6  1e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.13334e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0714  cotJC protein  25.41 
 
 
189 aa  51.6  1e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.98472e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0701  spore coat-associated protein JC  25.41 
 
 
189 aa  51.6  1e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000246142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0967  cotJC protein  25.41 
 
 
189 aa  51.6  1e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.89969e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0857  cotJC protein  25.41 
 
 
189 aa  51.6  1e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>