More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0633 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
408 aa  816    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  78.82 
 
 
408 aa  677    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  78.57 
 
 
411 aa  677    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.333208 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  74.94 
 
 
408 aa  652    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  42.46 
 
 
412 aa  312  7.999999999999999e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  41.96 
 
 
415 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  40.45 
 
 
407 aa  291  2e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  40.45 
 
 
414 aa  280  3e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  43.32 
 
 
408 aa  279  5e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  39.85 
 
 
404 aa  277  3e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  39.7 
 
 
414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  42.78 
 
 
404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  38.81 
 
 
414 aa  272  6e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  40 
 
 
412 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  37.72 
 
 
419 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  39.7 
 
 
414 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  38.65 
 
 
413 aa  270  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  39.55 
 
 
405 aa  268  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  38.68 
 
 
407 aa  259  6e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  37.68 
 
 
408 aa  258  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  40.81 
 
 
409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  39.54 
 
 
388 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  36.23 
 
 
404 aa  250  3e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  35.46 
 
 
413 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  37.44 
 
 
408 aa  246  4e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  35.92 
 
 
409 aa  238  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2372  phosphoglycerate kinase  36.87 
 
 
407 aa  233  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2549  Phosphoglycerate kinase  34.9 
 
 
407 aa  225  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3795  Phosphoglycerate kinase  36.39 
 
 
402 aa  223  6e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0534  Phosphoglycerate kinase  34.26 
 
 
405 aa  202  6e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70067  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  32.49 
 
 
399 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  33.16 
 
 
389 aa  186  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  32.92 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  31.82 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  31.81 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  34.26 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  31.22 
 
 
396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  31.22 
 
 
396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  32.07 
 
 
403 aa  182  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  30.48 
 
 
394 aa  180  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  31.57 
 
 
646 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  31.14 
 
 
392 aa  179  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  33.84 
 
 
655 aa  179  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  33.33 
 
 
395 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  31.22 
 
 
396 aa  178  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  32.07 
 
 
407 aa  177  4e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  33.58 
 
 
399 aa  177  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0876  phosphoglycerate kinase  32.51 
 
 
391 aa  177  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236749  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  31.31 
 
 
394 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  30.98 
 
 
397 aa  176  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  33.33 
 
 
399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1085  phosphoglycerate kinase  31.36 
 
 
391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00353094  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  32.74 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0879  Phosphoglycerate kinase  32.41 
 
 
393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.436803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  33 
 
 
395 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  32.15 
 
 
395 aa  173  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 
402 aa  172  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1167  phosphoglycerate kinase  29.14 
 
 
398 aa  172  1e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0754  phosphoglycerate kinase  30.6 
 
 
391 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.729853  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  29.65 
 
 
398 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0790  phosphoglycerate kinase  31.6 
 
 
391 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03158  3-phosphoglycerate kinase  31.13 
 
 
391 aa  170  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  30.65 
 
 
397 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0739  phosphoglycerate kinase  32.07 
 
 
395 aa  169  8e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000102804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3328  phosphoglycerate kinase  30.42 
 
 
391 aa  169  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.465511  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  29.77 
 
 
394 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  30.03 
 
 
394 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  29.52 
 
 
394 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  30.4 
 
 
397 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  30.3 
 
 
394 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  30.3 
 
 
394 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  29.77 
 
 
394 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  32.84 
 
 
400 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  29.77 
 
 
394 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  30.79 
 
 
398 aa  168  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  29.77 
 
 
394 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  31.06 
 
 
394 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  31.82 
 
 
443 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  31.65 
 
 
396 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  29.26 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  29.52 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  30.63 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0878  phosphoglycerate kinase  31.34 
 
 
391 aa  166  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  29.52 
 
 
394 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  31.55 
 
 
395 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  33 
 
 
395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  32 
 
 
401 aa  166  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  29.26 
 
 
394 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  32.16 
 
 
396 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2704  phosphoglycerate kinase  32.67 
 
 
407 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2539  Phosphoglycerate kinase  30.5 
 
 
412 aa  166  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  31.02 
 
 
398 aa  166  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2388  Phosphoglycerate kinase  30.38 
 
 
392 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 
398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  28.9 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  30.88 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0479  Phosphoglycerate kinase  32.32 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  30.92 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  31.57 
 
 
394 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  30.98 
 
 
392 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>